43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6290 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  86.48 
 
 
466 aa  793  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  86.05 
 
 
466 aa  792  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  98.07 
 
 
466 aa  924  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  100 
 
 
466 aa  937  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  84.98 
 
 
466 aa  799  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  86.05 
 
 
466 aa  792  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  63.68 
 
 
460 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  63.68 
 
 
460 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  63.68 
 
 
460 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  63.68 
 
 
460 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  55.05 
 
 
472 aa  446  1e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  53.85 
 
 
470 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  50.66 
 
 
499 aa  416  1e-115  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  45.93 
 
 
441 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  46.05 
 
 
452 aa  359  6e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  35.45 
 
 
469 aa  307  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  39.9 
 
 
468 aa  303  4e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16786e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  37.59 
 
 
453 aa  294  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  37.76 
 
 
458 aa  293  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  37.5 
 
 
459 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  38.46 
 
 
432 aa  285  1e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  37.68 
 
 
432 aa  281  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  35.08 
 
 
538 aa  276  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  35.2 
 
 
538 aa  276  8e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  35.68 
 
 
480 aa  273  4e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  36.68 
 
 
456 aa  273  4e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  37.04 
 
 
519 aa  273  5e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  34.01 
 
 
538 aa  273  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  33.57 
 
 
536 aa  265  9e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  35.95 
 
 
478 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  33.72 
 
 
438 aa  255  1e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  36.45 
 
 
434 aa  254  2e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  34.13 
 
 
440 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  32.37 
 
 
578 aa  242  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  33.89 
 
 
427 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  31.9 
 
 
441 aa  237  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  31.29 
 
 
436 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  31.5 
 
 
435 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  32.06 
 
 
436 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  32.06 
 
 
436 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  31.15 
 
 
435 aa  219  9e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  33.17 
 
 
437 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.36 
 
 
291 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>