More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6185 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  99.66 
 
 
310 aa  582  1e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
291 aa  582  1e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  92.78 
 
 
310 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1362  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  74.23 
 
 
333 aa  439  1e-122  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3211  KpsF/GutQ family sugar isomerase  73.54 
 
 
311 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3249  KpsF/GutQ family sugar isomerase  73.54 
 
 
311 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3262  arabinose-5-phosphate isomerase  73.54 
 
 
351 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6257  KpsF/GutQ family protein  67.49 
 
 
311 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  59.72 
 
 
311 aa  355  4e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  52.96 
 
 
321 aa  307  2e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  56.4 
 
 
320 aa  306  2e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  52.11 
 
 
318 aa  298  7e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  50.35 
 
 
315 aa  295  7e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  49.65 
 
 
315 aa  295  8e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  53.63 
 
 
310 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  50 
 
 
315 aa  293  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  53.63 
 
 
310 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  50.53 
 
 
342 aa  288  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  52.94 
 
 
317 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  52.26 
 
 
321 aa  282  4e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  8.47451e-08 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  52.74 
 
 
324 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  54.08 
 
 
339 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  50.35 
 
 
329 aa  276  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  53.71 
 
 
324 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  53.71 
 
 
324 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  53.55 
 
 
326 aa  273  2e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  50.53 
 
 
321 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  55.28 
 
 
333 aa  272  4e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  52.8 
 
 
324 aa  272  5e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  48.93 
 
 
319 aa  270  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  53.58 
 
 
333 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  50.88 
 
 
331 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  53 
 
 
324 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  52.54 
 
 
326 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  50.72 
 
 
322 aa  269  3e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  52.84 
 
 
324 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  52.84 
 
 
344 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  53.77 
 
 
333 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  51.56 
 
 
329 aa  265  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.53 
 
 
321 aa  266  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  51.79 
 
 
322 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  53.55 
 
 
330 aa  265  6e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  48.04 
 
 
320 aa  265  6e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  48.04 
 
 
320 aa  265  6e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  52.31 
 
 
324 aa  265  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  50.17 
 
 
323 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  51.1 
 
 
330 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  51.19 
 
 
324 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  49.83 
 
 
330 aa  263  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  53.12 
 
 
335 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  52.16 
 
 
345 aa  263  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  51.07 
 
 
322 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  52.16 
 
 
345 aa  263  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.52 
 
 
328 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  49.66 
 
 
323 aa  263  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  47.35 
 
 
315 aa  262  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  51.19 
 
 
324 aa  262  5e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  49.82 
 
 
321 aa  262  5e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  50.89 
 
 
332 aa  261  8e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.34 
 
 
328 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.34 
 
 
328 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.34 
 
 
328 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  50.34 
 
 
328 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.34 
 
 
328 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.34 
 
 
328 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.52 
 
 
357 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.34 
 
 
328 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  55.04 
 
 
332 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.2508e-05  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  50.34 
 
 
328 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.52 
 
 
328 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.34 
 
 
328 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.52 
 
 
342 aa  260  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  51.41 
 
 
329 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  50.9 
 
 
324 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  50.9 
 
 
324 aa  258  6e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  52.98 
 
 
330 aa  258  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  52.58 
 
 
325 aa  258  9e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  46.71 
 
 
339 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  49.13 
 
 
323 aa  257  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  48.42 
 
 
330 aa  256  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  52.43 
 
 
327 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  46.71 
 
 
339 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  9.39788e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  48.04 
 
 
326 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  46.71 
 
 
339 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  9.08304e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.83 
 
 
328 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.83 
 
 
328 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  53.5 
 
 
326 aa  256  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.83 
 
 
328 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.83 
 
 
328 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.83 
 
 
328 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  49.82 
 
 
323 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.83 
 
 
328 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  50.18 
 
 
340 aa  255  8e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  53.95 
 
 
335 aa  254  8e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  47.72 
 
 
330 aa  254  1e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  50.18 
 
 
330 aa  254  1e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.48 
 
 
328 aa  254  1e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  53.55 
 
 
327 aa  254  1e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  48.08 
 
 
320 aa  254  2e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  53.55 
 
 
327 aa  254  2e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>