14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6050 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6050  acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00630342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5820  acyl carrier protein  97.56 
 
 		 82 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.185115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1660  phosphopantetheine attachment site, putative  63.16 
 
 		 79 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0832602  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1580  phosphopantetheine attachment site, putative  63.16 
 
 		 79 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861905  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1225  phosphopantetheine-containing protein  63.16 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1573  thioesterase  35.48 
 
 		 561 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1976  amino acid adenylation  32.84 
 
 		 1373 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  32.73 
 
 		 4960 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  35 
 
 		 2581 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  32.73 
 
 		 4960 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  31.34 
 
 		 2199 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7003  acetoacetyl-CoA synthase  34.43 
 
 		 1056 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  31.03 
 
 		 2454 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0845  amino acid adenylation domain-containing protein  27.78 
 
 		 1119 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0731661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>