More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5920 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2975 aa  5852    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  39.04 
 
 		 2880 aa  795    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.86 
 
 		 4478 aa  619  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  40.89 
 
 		 2463 aa  612  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  37.68 
 
 		 3696 aa  606  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.77 
 
 		 3676 aa  600  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.61 
 
 		 3679 aa  595  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.61 
 
 		 3693 aa  592  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.61 
 
 		 3693 aa  592  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.34 
 
 		 3702 aa  588  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.35 
 
 		 3176 aa  582  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  40.17 
 
 		 3930 aa  573  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  38.56 
 
 		 7279 aa  570  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 7110 aa  568  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  37.75 
 
 		 3645 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  39.17 
 
 		 4080 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  38.78 
 
 		 3427 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  40.98 
 
 		 3711 aa  548  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  41.19 
 
 		 3463 aa  545  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  40.96 
 
 		 5255 aa  547  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  36.4 
 
 		 4882 aa  540  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  37.23 
 
 		 6768 aa  534  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  38.85 
 
 		 7210 aa  529  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 		 5154 aa  523  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  37.58 
 
 		 4151 aa  521  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  36.55 
 
 		 3449 aa  519  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.29 
 
 		 1656 aa  516  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 		 3092 aa  517  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.4 
 
 		 5400 aa  516  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 		 2551 aa  513  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 		 3874 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  38.45 
 
 		 3670 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5924  beta-ketoacyl synthase  37.02 
 
 		 2201 aa  499  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0606388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.32 
 
 		 1587 aa  496  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  37.56 
 
 		 3494 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  40.45 
 
 		 3254 aa  490  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  41.09 
 
 		 2966 aa  487  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  38.3 
 
 		 3158 aa  486  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.5 
 
 		 1354 aa  483  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  32.59 
 
 		 3780 aa  479  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  25.87 
 
 		 5854 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  40.35 
 
 		 2719 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  31.89 
 
 		 3781 aa  476  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 		 7157 aa  476  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0859  Beta-ketoacyl synthase  28.47 
 
 		 1601 aa  474  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.782867  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  36.42 
 
 		 4183 aa  469  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  42.12 
 
 		 2985 aa  471  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.02 
 
 		 1559 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  39.02 
 
 		 1559 aa  469  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.9 
 
 		 1874 aa  464  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  40.31 
 
 		 4575 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  37.37 
 
 		 2762 aa  464  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  40.48 
 
 		 1349 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  38.49 
 
 		 4840 aa  459  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.36 
 
 		 1087 aa  460  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.48 
 
 		 1349 aa  457  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.41 
 
 		 1372 aa  453  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  40.56 
 
 		 3099 aa  453  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  37.24 
 
 		 3493 aa  452  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  35.76 
 
 		 4264 aa  451  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  30.64 
 
 		 4036 aa  450  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  34.61 
 
 		 5802 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  33.13 
 
 		 2727 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  36.22 
 
 		 3252 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  44.6 
 
 		 2230 aa  443  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  37.88 
 
 		 4111 aa  440  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  54.21 
 
 		 2136 aa  440  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  37.54 
 
 		 3281 aa  439  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  42.45 
 
 		 2103 aa  436  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  42.07 
 
 		 3508 aa  437  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  38.34 
 
 		 2277 aa  434  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  40.67 
 
 		 2439 aa  433  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0863  Beta-ketoacyl synthase  29.1 
 
 		 1440 aa  433  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2365  polyketide synthase  50.43 
 
 		 1184 aa  433  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.518417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  43.93 
 
 		 3033 aa  434  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  39.19 
 
 		 3408 aa  433  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  43.08 
 
 		 2232 aa  434  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  52.64 
 
 		 1909 aa  433  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.67 
 
 		 1867 aa  431  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  38.9 
 
 		 1939 aa  430  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  43.62 
 
 		 2890 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  48.44 
 
 		 1827 aa  423  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  39.82 
 
 		 3148 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  28.85 
 
 		 2333 aa  424  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  28.06 
 
 		 2725 aa  423  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  42.22 
 
 		 2477 aa  424  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.18 
 
 		 1804 aa  416  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  36.02 
 
 		 4930 aa  417  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.56 
 
 		 1101 aa  416  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  43.13 
 
 		 1114 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  30.86 
 
 		 6876 aa  417  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  40.42 
 
 		 1806 aa  416  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  44.7 
 
 		 1805 aa  417  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.04 
 
 		 1337 aa  417  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  40.09 
 
 		 3130 aa  413  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  41.27 
 
 		 1190 aa  413  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  46.8 
 
 		 2107 aa  411  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  41.27 
 
 		 1190 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1007  Beta-ketoacyl synthase  51.15 
 
 		 1974 aa  413  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  38.1 
 
 		 1955 aa  413  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>