More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5919 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0859  Beta-ketoacyl synthase  33.03 
 
 
1601 aa  643  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.782867  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2463 aa  4866  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  39.09 
 
 
7157 aa  667  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5289  KR domain protein  36.71 
 
 
1911 aa  641  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  29.03 
 
 
5854 aa  671  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  32.97 
 
 
4036 aa  656  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0863  Beta-ketoacyl synthase  36.45 
 
 
1440 aa  626  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139933  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  35.09 
 
 
5802 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0861  Beta-ketoacyl synthase  28.6 
 
 
3525 aa  595  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  34.38 
 
 
2727 aa  552  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  36.42 
 
 
4478 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  33.73 
 
 
6876 aa  540  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3097  beta-ketoacyl synthase  38.42 
 
 
4869 aa  530  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5291  erythronolide synthase, Mycocerosate synthase  38.31 
 
 
4588 aa  505  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3096  erythronolide synthase  43.93 
 
 
1315 aa  496  1e-138  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  47.39 
 
 
3925 aa  497  1e-138  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.36 
 
 
1874 aa  493  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  38.29 
 
 
4429 aa  487  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  40.25 
 
 
5993 aa  487  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  33.39 
 
 
3676 aa  483  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1666  polyketide synthase, putative  47.13 
 
 
5566 aa  479  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  44.86 
 
 
2726 aa  476  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  38.55 
 
 
1559 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  43.96 
 
 
4539 aa  477  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  44.1 
 
 
4555 aa  476  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  48.85 
 
 
4614 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  44.82 
 
 
2653 aa  476  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.26 
 
 
1559 aa  471  1e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
3679 aa  474  1e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  44.71 
 
 
2880 aa  470  1e-130  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  37.96 
 
 
5612 aa  469  1e-130  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.17 
 
 
1587 aa  468  1e-130  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.63 
 
 
1354 aa  466  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  44.54 
 
 
3696 aa  466  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  34.56 
 
 
2393 aa  466  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.14 
 
 
2551 aa  460  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  45.91 
 
 
5628 aa  460  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.78 
 
 
1656 aa  461  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  37.93 
 
 
1349 aa  457  1e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.06 
 
 
1349 aa  457  1e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  40.8 
 
 
5778 aa  455  1e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  42.95 
 
 
4649 aa  452  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  40.5 
 
 
4212 aa  453  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  40.5 
 
 
5822 aa  452  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  40.05 
 
 
5915 aa  447  1e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3094  erythronolide synthase  41.52 
 
 
1262 aa  447  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  36.44 
 
 
1087 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  38.78 
 
 
2762 aa  440  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  40.66 
 
 
2230 aa  439  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.59 
 
 
3176 aa  438  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4312  erythronolide synthase  35.98 
 
 
2260 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.908395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.43 
 
 
1372 aa  439  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  43.67 
 
 
7149 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  45.35 
 
 
2725 aa  435  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  34.39 
 
 
2975 aa  432  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  41.27 
 
 
3693 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  39.28 
 
 
1144 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  41.27 
 
 
3693 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  41.67 
 
 
3702 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1007  Beta-ketoacyl synthase  44.75 
 
 
1974 aa  429  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.52 
 
 
2284 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  40.95 
 
 
2225 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  35.52 
 
 
3811 aa  427  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  39.53 
 
 
4101 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  41.87 
 
 
3099 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4314  beta-ketoacyl synthase  30.37 
 
 
3231 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.17 
 
 
2363 aa  422  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  39.39 
 
 
4580 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  40.52 
 
 
2232 aa  422  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  39.92 
 
 
4122 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  39.53 
 
 
4098 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  38.28 
 
 
3130 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  45.86 
 
 
1822 aa  418  1e-115  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  41.28 
 
 
2890 aa  418  1e-115  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  39.61 
 
 
4157 aa  417  1e-115  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  42.84 
 
 
1190 aa  418  1e-115  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  42.84 
 
 
1190 aa  420  1e-115  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  44.86 
 
 
3148 aa  419  1e-115  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2365  polyketide synthase  47.47 
 
 
1184 aa  418  1e-115  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.518417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  42.84 
 
 
1190 aa  418  1e-115  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  33.87 
 
 
2501 aa  419  1e-115  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.66 
 
 
1337 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  39.61 
 
 
4123 aa  416  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  39.49 
 
 
2103 aa  414  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  49.56 
 
 
2188 aa  412  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  39.94 
 
 
2477 aa  413  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  29.89 
 
 
3494 aa  409  1e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  41.34 
 
 
1658 aa  409  1e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  38.63 
 
 
1812 aa  409  1e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5924  beta-ketoacyl synthase  38.22 
 
 
2201 aa  409  1e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0606388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  49.68 
 
 
2136 aa  408  1e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  38.41 
 
 
4048 aa  410  1e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  38.94 
 
 
1939 aa  407  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  37.24 
 
 
4874 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  33.83 
 
 
1208 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  37.24 
 
 
5023 aa  407  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932a  modular polyketide synthase  40.96 
 
 
591 aa  407  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.527668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  42.08 
 
 
3645 aa  402  1e-110  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  50.11 
 
 
3427 aa  402  1e-110  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  37.16 
 
 
3818 aa  404  1e-110  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>