More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5918 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
352 aa  703  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.29 
 
 
355 aa  400  1e-110  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.56 
 
 
356 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.87 
 
 
354 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.8 
 
 
357 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.29 
 
 
356 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  55.84 
 
 
368 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2779  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.29 
 
 
354 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.25 
 
 
368 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3859  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.68 
 
 
352 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.67 
 
 
368 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.56 
 
 
368 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  56.7 
 
 
368 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.5 
 
 
356 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  56.13 
 
 
368 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3776  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.54 
 
 
352 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  57.43 
 
 
365 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.84 
 
 
368 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.09 
 
 
368 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.81 
 
 
368 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.7 
 
 
361 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.59 
 
 
353 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.33995e-32 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3719  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.69 
 
 
354 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.717818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.81 
 
 
368 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0361  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.02 
 
 
355 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  6.24901e-08 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3839  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.26 
 
 
352 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.431413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.01 
 
 
353 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  54.99 
 
 
358 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.99 
 
 
358 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.29 
 
 
356 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.13 
 
 
355 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1715  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.02 
 
 
359 aa  363  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal  0.0532635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2394  NADH--flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.98 
 
 
354 aa  362  7e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3775  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.5 
 
 
379 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.797165  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  55.43 
 
 
359 aa  358  9e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.26 
 
 
354 aa  355  5e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.818781  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1718  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.78 
 
 
355 aa  353  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0381  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.07 
 
 
362 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.79 
 
 
365 aa  349  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.0595836 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  52.72 
 
 
370 aa  347  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  53.58 
 
 
354 aa  342  4e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4902  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.69 
 
 
358 aa  342  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2882  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.84 
 
 
360 aa  341  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.458184  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.43 
 
 
369 aa  340  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  49.57 
 
 
371 aa  338  1e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0761  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54 
 
 
348 aa  337  2e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.867134  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 
370 aa  336  4e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.7 
 
 
360 aa  335  7e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.57 
 
 
780 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1843  NADPH dehydrogenase NamA  46.88 
 
 
345 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0655  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.15 
 
 
367 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.208433  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1891  NADPH dehydrogenase NamA  46.59 
 
 
345 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2038  NADPH dehydrogenase NamA  46.59 
 
 
345 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12610  NADH:flavin oxidoreductase  53.49 
 
 
368 aa  329  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.461944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1059  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.42 
 
 
386 aa  328  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0160422  normal  0.54744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1529  NADPH dehydrogenase NamA  46.59 
 
 
346 aa  328  8e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  48.15 
 
 
370 aa  328  1e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0431  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.12 
 
 
365 aa  327  2e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0132994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2106  NADPH dehydrogenase NamA  46.02 
 
 
345 aa  327  2e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  49 
 
 
782 aa  327  2e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1853  NADPH dehydrogenase NamA  46.02 
 
 
345 aa  326  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.73 
 
 
368 aa  325  5e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2275  NADPH dehydrogenase NamA  48.86 
 
 
340 aa  325  6e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.82972e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2028  NADPH dehydrogenase NamA  45.45 
 
 
345 aa  325  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2070  NADPH dehydrogenase NamA  46.31 
 
 
345 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.29 
 
 
371 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2139  NADPH dehydrogenase NamA  45.74 
 
 
345 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.72 
 
 
370 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3016  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
365 aa  323  4e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.824426  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0090  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49 
 
 
370 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.72 
 
 
370 aa  321  1e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3524  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.89 
 
 
366 aa  321  1e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.110487  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.72 
 
 
370 aa  321  1e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3281  NADPH dehydrogenase NamA  45.45 
 
 
345 aa  320  2e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1888  NADPH dehydrogenase NamA  45.89 
 
 
345 aa  320  2e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0520303  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0071  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.72 
 
 
370 aa  320  2e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282645  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0350  NADPH dehydrogenase NamA  48.86 
 
 
340 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2608  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.43 
 
 
371 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1573  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.86 
 
 
365 aa  319  4e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3253  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.86 
 
 
370 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0319  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.84 
 
 
351 aa  318  8e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.254324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.87 
 
 
364 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  46.72 
 
 
370 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  46.72 
 
 
370 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2864  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.15 
 
 
364 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  46.72 
 
 
370 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.15 
 
 
370 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3010  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.87 
 
 
364 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7562  NADPH dehydrogenase  46 
 
 
370 aa  314  1e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.87 
 
 
364 aa  314  2e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.438588  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2205  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.15 
 
 
372 aa  313  3e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.88 
 
 
370 aa  312  4e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2396  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.58 
 
 
368 aa  313  4e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2687  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.29 
 
 
373 aa  312  5e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2970  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.42 
 
 
404 aa  311  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3060  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.87 
 
 
376 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455155  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2248  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.43 
 
 
372 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.674578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2523  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.43 
 
 
372 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0620053  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.57 
 
 
364 aa  309  4e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3927  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.87 
 
 
370 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0013465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>