More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5917 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5917  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
315 aa  610  1e-174  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00147293 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  36.05 
 
 
2463 aa  73.2  5e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  42.53 
 
 
2093 aa  72.8  7e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  41.74 
 
 
2820 aa  72.4  1e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1677  non-ribosomal peptide synthase  42.86 
 
 
3157 aa  68.9  9e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0189  polyketide synthase peptide synthetase fusion protein  42.86 
 
 
3133 aa  68.9  9e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  42.86 
 
 
3148 aa  68.9  1e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  38.83 
 
 
5953 aa  68.2  2e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  43.82 
 
 
2174 aa  67.8  3e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  42.05 
 
 
6889 aa  67.4  3e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  41.67 
 
 
13537 aa  67  4e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  41.44 
 
 
6676 aa  66.6  5e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  34.2 
 
 
4318 aa  66.2  7e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  47.95 
 
 
2250 aa  65.9  8e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  9.13323e-05 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 
1419 aa  65.9  9e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.169022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  39.05 
 
 
8646 aa  65.9  9e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1211  polyketide synthase  43.27 
 
 
3044 aa  65.9  9e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165811  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  44.78 
 
 
1786 aa  65.9  9e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  41.58 
 
 
3231 aa  65.5  1e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  53.03 
 
 
2706 aa  65.1  1e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4309  amino acid adenylation domain protein  45.35 
 
 
2577 aa  65.1  1e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.867052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  44 
 
 
2258 aa  64.3  2e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.14 
 
 
9498 aa  64.3  3e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1704  amino acid adenylation  36.84 
 
 
1322 aa  63.9  3e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.410435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  42.59 
 
 
2125 aa  64.3  3e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  30.72 
 
 
1302 aa  64.3  3e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3431  amino acid adenylation domain protein  37.96 
 
 
1813 aa  63.5  4e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2414  AMP-dependent synthetase and ligase  41.43 
 
 
1818 aa  63.5  4e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  30.99 
 
 
974 aa  63.5  5e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4503  amino acid adenylation domain protein  34.38 
 
 
639 aa  63.2  6e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4894  amino acid adenylation domain-containing protein  42.7 
 
 
1083 aa  63.2  6e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950239  normal  0.0263577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  34.71 
 
 
1528 aa  62.8  7e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4720  acetoacetyl-CoA synthase  47.3 
 
 
1021 aa  62.8  7e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  43.48 
 
 
3328 aa  62.8  8e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  43.48 
 
 
3352 aa  62.8  8e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  39.36 
 
 
6081 aa  62.8  8e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  43.02 
 
 
1457 aa  62.8  8e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  43.02 
 
 
1457 aa  62.8  8e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  39.36 
 
 
6072 aa  62.4  9e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  31.73 
 
 
3453 aa  62.4  9e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  39.36 
 
 
6006 aa  62.4  9e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  31.82 
 
 
1069 aa  62.4  9e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  38.24 
 
 
4531 aa  62.4  9e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  49.21 
 
 
3710 aa  62  1e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  40.45 
 
 
6403 aa  62.4  1e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  41.67 
 
 
1795 aa  62  1e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 
1084 aa  61.6  1e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1598  amino acid adenylation domain-containing protein  42.05 
 
 
3219 aa  62  1e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546873 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  43.02 
 
 
1457 aa  62.4  1e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  41.79 
 
 
1574 aa  62  1e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  34.41 
 
 
2626 aa  62  1e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  38.57 
 
 
6661 aa  62  1e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  32.11 
 
 
7168 aa  61.2  2e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  1.12945e-06 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  43.28 
 
 
1454 aa  61.6  2e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  28.93 
 
 
4048 aa  61.6  2e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  43.9 
 
 
4647 aa  61.2  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  38.89 
 
 
1514 aa  61.2  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2092  amino acid adenylation domain-containing protein  31.48 
 
 
1661 aa  61.6  2e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  40.26 
 
 
1497 aa  61.2  2e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 
7712 aa  61.2  2e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  35.29 
 
 
2625 aa  61.2  2e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3501  polyketide synthase type I  36.27 
 
 
119 aa  61.2  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2147  pyoverdine sidechain peptide synthetase I, epsilon-Lys module  33.63 
 
 
1104 aa  61.2  2e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.240441  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  43.28 
 
 
2316 aa  61.6  2e-08  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1957  amino acid adenylation  32.74 
 
 
1136 aa  61.6  2e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  37.61 
 
 
5328 aa  60.8  3e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  47.62 
 
 
2614 aa  60.8  3e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  45.45 
 
 
2226 aa  60.5  3e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  38.2 
 
 
3235 aa  60.1  4e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7003  acetoacetyl-CoA synthase  40 
 
 
1056 aa  60.5  4e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  37.18 
 
 
5596 aa  60.1  4e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  29.63 
 
 
3021 aa  60.1  4e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3345  non-ribosomal peptide synthetase  37.25 
 
 
1059 aa  60.1  5e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  42.86 
 
 
2230 aa  60.1  5e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  43.16 
 
 
8915 aa  60.1  5e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  35.56 
 
 
1436 aa  60.1  5e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  45.45 
 
 
1726 aa  60.1  5e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  40.22 
 
 
8914 aa  59.7  6e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  33.06 
 
 
3308 aa  59.7  6e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  40.26 
 
 
3108 aa  59.7  6e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  45 
 
 
2243 aa  59.7  6e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  34.18 
 
 
3093 aa  59.7  7e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  31.94 
 
 
4646 aa  59.3  8e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  42.42 
 
 
1753 aa  58.9  1e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  34.67 
 
 
2106 aa  58.5  1e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  42.65 
 
 
4186 aa  58.9  1e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  46.88 
 
 
3219 aa  58.5  1e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  38.81 
 
 
2581 aa  58.5  1e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  25.38 
 
 
4354 aa  58.9  1e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  42.11 
 
 
3296 aa  58.9  1e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  43.33 
 
 
1469 aa  58.9  1e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  40.3 
 
 
2419 aa  58.9  1e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  36.73 
 
 
2151 aa  58.9  1e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4486  amino acid adenylation domain protein  43.28 
 
 
1691 aa  58.9  1e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 
2273 aa  58.2  2e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  40 
 
 
2350 aa  58.5  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  38.46 
 
 
1035 aa  58.2  2e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  37.25 
 
 
3002 aa  58.5  2e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  37.86 
 
 
7310 aa  58.2  2e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1593  non-ribosomal peptide synthase  43.28 
 
 
1346 aa  57.8  2e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>