More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5915 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5915  condensation domain-containing protein  100 
 
 
512 aa  1006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.416497  decreased coverage  0.00198316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  24.81 
 
 
3824 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  24.56 
 
 
2664 aa  122  2e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  25.46 
 
 
3308 aa  112  2e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  26.61 
 
 
3498 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  27.97 
 
 
2883 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3820  AMP-dependent synthetase and ligase  24.61 
 
 
1453 aa  103  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  32.62 
 
 
1911 aa  103  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  29.26 
 
 
2155 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  30.69 
 
 
1137 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  29.31 
 
 
5698 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  29.82 
 
 
1199 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  26.92 
 
 
2883 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  24.29 
 
 
1436 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  26.12 
 
 
2054 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  28.16 
 
 
4747 aa  94.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1677  amino acid adenylation domain protein  27.56 
 
 
3289 aa  95.1  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  26.1 
 
 
6661 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4309  amino acid adenylation domain protein  29.53 
 
 
2577 aa  94.7  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.867052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  29.34 
 
 
2201 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3738  FkbH like protein  23.42 
 
 
1231 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0423979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3684  FkbH like protein  23.42 
 
 
1231 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  23.83 
 
 
1142 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  27.92 
 
 
2174 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  28.31 
 
 
2189 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  27.04 
 
 
2875 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  22.26 
 
 
6404 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.18 
 
 
3432 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  26.67 
 
 
6202 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8726e-05 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  34.96 
 
 
3639 aa  91.3  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  31.34 
 
 
6176 aa  90.9  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  28.83 
 
 
1837 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  27.6 
 
 
5654 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  21.71 
 
 
2395 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  30.09 
 
 
4318 aa  90.1  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  27.16 
 
 
1369 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  20.18 
 
 
3086 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  27.33 
 
 
4317 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0845  amino acid adenylation domain-containing protein  27.48 
 
 
1119 aa  89.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  28.97 
 
 
2606 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  27.78 
 
 
3432 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.38 
 
 
1806 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  21.71 
 
 
2395 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  20.47 
 
 
3086 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  25.36 
 
 
4960 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  29.92 
 
 
13537 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  25.71 
 
 
2448 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  25.36 
 
 
3235 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  28.29 
 
 
1104 aa  88.6  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  25.94 
 
 
9175 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  28.57 
 
 
1104 aa  88.2  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  28.84 
 
 
7712 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  28.03 
 
 
1689 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  24.36 
 
 
4960 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0467  amino acid adenylation domain protein  24.69 
 
 
2105 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  26.67 
 
 
7168 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  1.12945e-06 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  28.42 
 
 
3235 aa  87  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  28.17 
 
 
3111 aa  87  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  27.63 
 
 
1138 aa  86.3  1e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  25.64 
 
 
4968 aa  86.3  1e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3681  amino acid adenylation domain protein  28.01 
 
 
1142 aa  86.3  1e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  25.52 
 
 
1789 aa  85.9  1e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  25.66 
 
 
3942 aa  86.7  1e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  25.09 
 
 
1550 aa  85.9  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  24.15 
 
 
1449 aa  85.9  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  28.2 
 
 
4037 aa  85.5  2e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  30.09 
 
 
5149 aa  85.5  2e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  24.71 
 
 
4502 aa  85.5  2e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  30.66 
 
 
4991 aa  85.9  2e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  26.97 
 
 
1370 aa  85.5  2e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  29.84 
 
 
6403 aa  84.7  3e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  29.21 
 
 
1835 aa  85.1  3e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  27.45 
 
 
3650 aa  85.1  3e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  26.71 
 
 
2845 aa  85.1  3e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  28.37 
 
 
6889 aa  84.7  3e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  28.77 
 
 
5953 aa  85.1  3e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  28.88 
 
 
4483 aa  84.7  4e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  26.38 
 
 
4354 aa  84.7  4e-15  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3578  amino acid adenylation domain protein  28.21 
 
 
2098 aa  84.7  4e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  28.57 
 
 
2106 aa  84.3  5e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  25.72 
 
 
2666 aa  84.3  5e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  30.51 
 
 
5926 aa  84.3  5e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  27.34 
 
 
5738 aa  84  6e-15  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  27.18 
 
 
1506 aa  84  6e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  24.92 
 
 
4317 aa  83.6  8e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  25.79 
 
 
1528 aa  83.6  8e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  31.67 
 
 
1356 aa  83.2  9e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4486  amino acid adenylation domain protein  29.41 
 
 
1691 aa  83.2  9e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  23.59 
 
 
4336 aa  83.2  1e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  25.75 
 
 
4317 aa  83.2  1e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4498  amino acid adenylation domain protein  29.48 
 
 
1892 aa  82.8  1e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.693218  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  28.53 
 
 
2706 aa  82.8  1e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  26.12 
 
 
4342 aa  82.8  1e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  23.9 
 
 
2997 aa  82.8  1e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  23.48 
 
 
2878 aa  83.2  1e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  26.86 
 
 
2250 aa  82.8  1e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  9.13323e-05 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  25.97 
 
 
2571 aa  82.4  2e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  26.44 
 
 
4342 aa  82.4  2e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  26.12 
 
 
1776 aa  82.4  2e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  29.26 
 
 
3331 aa  82.4  2e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>