More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5834 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  98.52 
 
 		 1151 aa  2299    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  60.37 
 
 		 1139 aa  1285    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  62.84 
 
 		 1138 aa  1323    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  57.62 
 
 		 1141 aa  1247    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  56.82 
 
 		 1149 aa  1196    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  89.49 
 
 		 1148 aa  2046    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 1151 aa  2329    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.91 
 
 		 1117 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 		 1105 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  34.88 
 
 		 1122 aa  525  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 		 1048 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  38.52 
 
 		 1063 aa  391  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  33.06 
 
 		 1134 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 		 1037 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 1403 aa  356  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.85 
 
 		 1080 aa  356  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  29.95 
 
 		 1377 aa  352  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.59 
 
 		 1081 aa  351  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.52 
 
 		 1089 aa  328  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  31.78 
 
 		 1093 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 		 1402 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.67 
 
 		 1175 aa  307  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 		 1046 aa  300  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  28.69 
 
 		 1043 aa  295  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 		 1065 aa  294  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.57 
 
 		 1291 aa  292  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  28.49 
 
 		 1055 aa  287  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.85 
 
 		 1160 aa  280  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.08 
 
 		 1053 aa  280  9e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  29.37 
 
 		 1227 aa  277  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.91 
 
 		 1055 aa  276  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  29.49 
 
 		 1050 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.49 
 
 		 1050 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.62 
 
 		 1014 aa  265  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  28.29 
 
 		 1123 aa  247  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.4 
 
 		 1429 aa  240  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.37 
 
 		 1142 aa  237  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  29.26 
 
 		 1126 aa  233  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.28 
 
 		 1398 aa  231  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.62 
 
 		 1403 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  26.46 
 
 		 1094 aa  224  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 		 1198 aa  220  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.04 
 
 		 1422 aa  219  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.79 
 
 		 1133 aa  217  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.82 
 
 		 1360 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.05 
 
 		 1023 aa  207  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  26.17 
 
 		 1311 aa  204  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 1298 aa  199  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.76 
 
 		 1441 aa  197  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  26.17 
 
 		 1271 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  27.38 
 
 		 1027 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  27.38 
 
 		 1027 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.14 
 
 		 1295 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 		 1285 aa  187  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  26.57 
 
 		 1027 aa  184  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  24.6 
 
 		 1349 aa  184  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  24.6 
 
 		 1349 aa  184  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.62 
 
 		 1226 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 		 1342 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  27.86 
 
 		 1204 aa  180  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 		 1349 aa  180  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.67 
 
 		 1190 aa  179  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.99 
 
 		 1087 aa  178  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  26.44 
 
 		 1358 aa  176  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  24.63 
 
 		 1348 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.35 
 
 		 1096 aa  170  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.89 
 
 		 1067 aa  166  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  25.6 
 
 		 1359 aa  164  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  25.48 
 
 		 1353 aa  163  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  25.51 
 
 		 1213 aa  157  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  25.51 
 
 		 1359 aa  157  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  25.8 
 
 		 1359 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  25.51 
 
 		 1359 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  25.51 
 
 		 1359 aa  157  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  25.51 
 
 		 1350 aa  156  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  20.82 
 
 		 1153 aa  154  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  25.63 
 
 		 1289 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 		 1190 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.89 
 
 		 1264 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  29 
 
 		 1015 aa  132  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 		 966 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 		 956 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  31.56 
 
 		 320 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  31.56 
 
 		 320 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  24.78 
 
 		 1130 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  30.75 
 
 		 961 aa  125  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.27 
 
 		 805 aa  125  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  36.67 
 
 		 665 aa  122  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  34.55 
 
 		 735 aa  122  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  28.54 
 
 		 993 aa  121  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.04 
 
 		 1468 aa  118  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 1193 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.06 
 
 		 1034 aa  116  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  24.85 
 
 		 1029 aa  115  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  30.96 
 
 		 965 aa  115  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 1320 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  26.67 
 
 		 1055 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.38 
 
 		 919 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  28.61 
 
 		 972 aa  112  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  28.04 
 
 		 983 aa  112  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>