More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5822 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  99.01 
 
 		 405 aa  777    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  88.64 
 
 		 405 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  92.06 
 
 		 405 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  91.81 
 
 		 405 aa  697    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  92.06 
 
 		 405 aa  700    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  80.94 
 
 		 404 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  80.05 
 
 		 404 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  79.38 
 
 		 388 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  73.8 
 
 		 400 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  73.8 
 
 		 400 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  73.53 
 
 		 400 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  68.14 
 
 		 398 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  66.31 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  61.78 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  58.85 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  51.14 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  60.61 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  61.67 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  60.1 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  60.89 
 
 		 399 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  62.57 
 
 		 402 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  51.33 
 
 		 398 aa  326  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  51.93 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  46.05 
 
 		 389 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  46.05 
 
 		 389 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  47.28 
 
 		 396 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  47.94 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  44.56 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  48.23 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  46.06 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  51.21 
 
 		 408 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  46.03 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  48.16 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  43.27 
 
 		 405 aa  258  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  39.21 
 
 		 392 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  37.43 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  37.43 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  37.43 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 416 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  50.86 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 399 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 399 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 425 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  43.44 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.12 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2698  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746968  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  42.44 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  42.44 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  42.44 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  42.44 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  42.44 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  42.44 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  42.44 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  42.5 
 
 		 413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 		 410 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 431 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 405 aa  212  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  38.56 
 
 		 394 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  38.56 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  38.56 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 395 aa  211  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 401 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 389 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.74 
 
 		 411 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  38.05 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 427 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  41.29 
 
 		 422 aa  206  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  38.82 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  39.95 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  39.95 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  39.95 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  39.85 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  39.95 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>