More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5756 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6864  aldehyde dehydrogenase  89.13 
 
 		 497 aa  877    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0403228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5756  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 497 aa  1010    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  56.91 
 
 		 505 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1371  aldehyde dehydrogenase  57.56 
 
 		 500 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0762191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2110  aldehyde dehydrogenase  55.89 
 
 		 502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0052069  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7257  aldehyde dehydrogenase  58.45 
 
 		 505 aa  584  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  56.21 
 
 		 505 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  55.76 
 
 		 505 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4109  aldehyde dehydrogenase  55.35 
 
 		 496 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1689  Aldehyde Dehydrogenase  55.67 
 
 		 500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.337297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09710  putative aldehyde dehydrogenase  57.29 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000831166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4003  aldehyde dehydrogenase  55.24 
 
 		 498 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2545  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.92 
 
 		 511 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572579 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4752  aldehyde dehydrogenase  55.04 
 
 		 501 aa  532  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0227  aldehyde dehydrogenase  51.53 
 
 		 499 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  51.21 
 
 		 495 aa  531  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0092  aldehyde dehydrogenase family protein  51.73 
 
 		 497 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.769215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4933  aldehyde dehydrogenase  51.81 
 
 		 497 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6087  putative aldehyde dehydrogenase  51.93 
 
 		 497 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1623  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.92 
 
 		 499 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70140  putative aldehyde dehydrogenase  51.93 
 
 		 497 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5278  aldehyde dehydrogenase family protein  51.93 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5188  aldehyde dehydrogenase  52.14 
 
 		 526 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536573  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1737  aldehyde dehydrogenase  51.22 
 
 		 498 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000892172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31630  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.3 
 
 		 491 aa  522  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5330  aldehyde dehydrogenase  51.93 
 
 		 497 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557529 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3034  aldehyde dehydrogenase  50.2 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.329193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0192  aldehyde dehydrogenase  51.12 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5534  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.1 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0237  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.9 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1216  aldehyde dehydrogenase  51.63 
 
 		 498 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2589  aldehyde dehydrogenase family protein  50.81 
 
 		 497 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2123  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.29 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3021  aldehyde dehydrogenase  48.69 
 
 		 498 aa  510  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3105  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.29 
 
 		 498 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2872  aldehyde dehydrogenase  49.8 
 
 		 496 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.442211  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3127  aldehyde dehydrogenase  50.2 
 
 		 497 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3859  aldehyde dehydrogenase  53.23 
 
 		 497 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3249  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 497 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0656585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2648  aldehyde dehydrogenase  49.39 
 
 		 498 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0049  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.4 
 
 		 505 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2926  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.29 
 
 		 498 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  49.39 
 
 		 499 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1741  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.81 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2725  aldehyde dehydrogenase  51.87 
 
 		 493 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3008  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.88 
 
 		 498 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.227807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1153  aldehyde dehydrogenase  48.88 
 
 		 498 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0967  aldehyde dehydrogenase  48.18 
 
 		 498 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.593803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1187  aldehyde dehydrogenase  48.88 
 
 		 498 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0298  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.36 
 
 		 499 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1115  aldehyde dehydrogenase  47.9 
 
 		 502 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00211349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2836  aldehyde dehydrogenase  50.2 
 
 		 495 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123667  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1093  aldehyde dehydrogenase  48.47 
 
 		 498 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0180881  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3496  aldehyde dehydrogenase  48.28 
 
 		 498 aa  498  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1909  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.8 
 
 		 499 aa  495  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.295691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0937  aldehyde dehydrogenase  48.47 
 
 		 499 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370684  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3202  Aldehyde Dehydrogenase  48.47 
 
 		 498 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.394681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0305  putative aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 496 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3533  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.8 
 
 		 495 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185726  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1085  aldehyde dehydrogenase  48.47 
 
 		 498 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000455021  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3176  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.8 
 
 		 495 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2990  aldehyde dehydrogenase  54.07 
 
 		 496 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48030  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  51.01 
 
 		 497 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0945  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.53 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1187  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.7 
 
 		 509 aa  488  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2376  aldehyde dehydrogenase  54.07 
 
 		 496 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02680  putative aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 496 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.24739 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3567  aldehyde dehydrogenase  51.53 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1045  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  46 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6645  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.3 
 
 		 501 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217332  normal  0.0894525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3010  aldehyde dehydrogenase  54.07 
 
 		 496 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4669  Aldehyde Dehydrogenase  51.53 
 
 		 497 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2984  aldehyde dehydrogenase  53.86 
 
 		 496 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6339  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.66 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1942  aldehyde dehydrogenase family protein  51.93 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2065  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.65 
 
 		 498 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.18 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0642  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  51.61 
 
 		 496 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0734  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  51.61 
 
 		 528 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2026  aldehyde dehydrogenase family protein  51.61 
 
 		 496 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.25 
 
 		 495 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 495 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0566  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.5 
 
 		 504 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7675  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.62 
 
 		 496 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 		 495 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  46.84 
 
 		 495 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3037  aldehyde dehydrogenase  52.85 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  46.84 
 
 		 495 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  46.84 
 
 		 495 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.84 
 
 		 495 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0356  aldehyde dehydrogenase  49.5 
 
 		 489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.69961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.84 
 
 		 495 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2900  aldehyde dehydrogenase  52.64 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6073  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.11 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.972484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 		 495 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1330  Aldehyde Dehydrogenase  51.01 
 
 		 498 aa  461  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174379  normal  0.217301 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4432  Aldehyde Dehydrogenase  47.69 
 
 		 492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1869  aldehyde dehydrogenase  49.39 
 
 		 496 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3527  aldehyde dehydrogenase  43.15 
 
 		 495 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000694209  normal  0.0931426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>