213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5647 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  99.68 
 
 
316 aa  648  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
316 aa  649  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  92.72 
 
 
316 aa  612  1e-174  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  92.72 
 
 
316 aa  612  1e-174  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  92.72 
 
 
316 aa  611  1e-174  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  87.34 
 
 
316 aa  577  1e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  84.18 
 
 
316 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  84.49 
 
 
316 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  84.18 
 
 
316 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  65.18 
 
 
315 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  64.2 
 
 
330 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  64.2 
 
 
330 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  61.66 
 
 
330 aa  416  1e-115  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  61.9 
 
 
318 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  83.33 
 
 
233 aa  398  1e-110  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  83.33 
 
 
233 aa  398  1e-110  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  59.16 
 
 
465 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  56.69 
 
 
329 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  52.41 
 
 
333 aa  340  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  49.52 
 
 
347 aa  321  1e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  46.79 
 
 
314 aa  292  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  45.22 
 
 
328 aa  288  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  41.27 
 
 
315 aa  225  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  40.18 
 
 
326 aa  197  2e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  37.81 
 
 
319 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  40.31 
 
 
319 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  39.57 
 
 
350 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  37.96 
 
 
338 aa  184  2e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  38.78 
 
 
314 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  36.84 
 
 
342 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  36.14 
 
 
325 aa  162  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  36.45 
 
 
325 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  83.95 
 
 
81 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  83.95 
 
 
81 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
346 aa  60.1  5e-08  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
414 aa  58.2  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
689 aa  56.2  7e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  32.28 
 
 
392 aa  55.8  9e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  31.25 
 
 
431 aa  54.3  2e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  31.5 
 
 
397 aa  55.1  2e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2417  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
373 aa  54.3  2e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
367 aa  53.1  6e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5208  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
425 aa  53.1  6e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  normal  0.673241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  35.87 
 
 
370 aa  52.4  1e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 
381 aa  52.4  1e-05  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 
393 aa  50.8  3e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  29.92 
 
 
396 aa  50.8  3e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  30.63 
 
 
409 aa  50.8  3e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
358 aa  50.8  3e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
386 aa  50.4  4e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  27.27 
 
 
382 aa  50.4  4e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
366 aa  50.1  5e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
376 aa  50.1  5e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
384 aa  50.1  5e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
385 aa  50.1  5e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  37.08 
 
 
393 aa  50.1  5e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
394 aa  50.1  6e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
392 aa  49.7  6e-05  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  22.44 
 
 
383 aa  49.7  6e-05  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  30.71 
 
 
401 aa  49.7  7e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2850  hypothetical protein  26.92 
 
 
311 aa  49.3  8e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
386 aa  49.3  8e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
408 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  30.7 
 
 
363 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
398 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
406 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
405 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
371 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  31.01 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  34.12 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
384 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.12 
 
 
385 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
378 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  32.73 
 
 
411 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
373 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
440 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
414 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  35.23 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
371 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2121  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
372 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.430294  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  28.3 
 
 
349 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
360 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  26.72 
 
 
384 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  34 
 
 
654 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  33.77 
 
 
367 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  30.77 
 
 
416 aa  47.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
435 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
408 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
409 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
412 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
375 aa  47  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
387 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
374 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>