More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5629 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  755    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  98.27 
 
 		 404 aa  743    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  80.48 
 
 		 403 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  80.48 
 
 		 403 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  66.22 
 
 		 400 aa  465  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  68.07 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  66.76 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  66.05 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  61.48 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  64.36 
 
 		 416 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  63.88 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  68.12 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  59.08 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  62.19 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  59.47 
 
 		 404 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  61.39 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  58.4 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  61.67 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  57.44 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  61.35 
 
 		 376 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  63.85 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  56.38 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  56.1 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  54.75 
 
 		 420 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  52.07 
 
 		 396 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  56.95 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  51.59 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  45.38 
 
 		 401 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  50.75 
 
 		 398 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  50.75 
 
 		 398 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  44.85 
 
 		 395 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  47.19 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  46.36 
 
 		 400 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  47.75 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  46.94 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  46.94 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  47.23 
 
 		 433 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 403 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  47.78 
 
 		 400 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  46.86 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 408 aa  272  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  47.5 
 
 		 400 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  46.46 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 413 aa  265  8e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  48.69 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  41.43 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  38.85 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  38.85 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  38.85 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  38.85 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  38.85 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  38.85 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 		 402 aa  192  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  37.74 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  39.09 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 392 aa  179  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  35.95 
 
 		 408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 408 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 402 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 402 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  35.25 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 399 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 735 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 390 aa  133  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  32.91 
 
 		 400 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  30.51 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  32.58 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 387 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  30.3 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  29.63 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  30.65 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>