More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5591 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  94.19 
 
 
1137 aa  2170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  56.41 
 
 
1100 aa  1185  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  63.24 
 
 
553 aa  755  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  56.18 
 
 
1061 aa  1165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  55.56 
 
 
1098 aa  1038  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  59.68 
 
 
572 aa  711  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  62.06 
 
 
548 aa  716  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  47.28 
 
 
1109 aa  919  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  54.08 
 
 
1088 aa  1095  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  58.64 
 
 
1106 aa  1259  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  47.26 
 
 
1108 aa  968  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  58.28 
 
 
1105 aa  1263  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  53.44 
 
 
1092 aa  1091  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  53.47 
 
 
1088 aa  1088  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  94.37 
 
 
1137 aa  2173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  99.3 
 
 
1137 aa  2299  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  47.58 
 
 
1123 aa  931  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  49.23 
 
 
1094 aa  997  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  59.74 
 
 
601 aa  678  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.02471e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  58.19 
 
 
1106 aa  1258  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  51.1 
 
 
1101 aa  1035  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  62.62 
 
 
556 aa  717  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  45.04 
 
 
1121 aa  884  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  45.9 
 
 
1098 aa  934  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  59.27 
 
 
571 aa  685  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  59.82 
 
 
596 aa  681  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  50.18 
 
 
1142 aa  1035  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  79.82 
 
 
1131 aa  1790  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  79.82 
 
 
1131 aa  1790  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  52.99 
 
 
1102 aa  1107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  79.73 
 
 
1131 aa  1788  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  79.82 
 
 
1131 aa  1792  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  59.82 
 
 
596 aa  681  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  79.82 
 
 
1131 aa  1790  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  53.85 
 
 
1102 aa  1106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  57.14 
 
 
1100 aa  1234  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  8.83241e-07 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  89.93 
 
 
1136 aa  2068  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  59.01 
 
 
1110 aa  1282  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  70.01 
 
 
1152 aa  1607  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  70.42 
 
 
1154 aa  1620  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  60.12 
 
 
1164 aa  1334  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  58.68 
 
 
1093 aa  1257  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  60.12 
 
 
1164 aa  1334  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  44.63 
 
 
1116 aa  921  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  42.79 
 
 
1113 aa  887  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  59.96 
 
 
604 aa  684  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  58.27 
 
 
558 aa  646  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  58.96 
 
 
582 aa  677  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  6.1423e-06  hitchhiker  2.15015e-06 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  46.42 
 
 
1139 aa  926  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  62.32 
 
 
601 aa  708  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  64.05 
 
 
551 aa  757  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  59.2 
 
 
562 aa  664  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  60.85 
 
 
567 aa  697  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  41.32 
 
 
1114 aa  820  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  58.08 
 
 
610 aa  687  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  52.9 
 
 
964 aa  672  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  60.66 
 
 
591 aa  676  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  61.9 
 
 
577 aa  708  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  50.31 
 
 
1109 aa  1031  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  58.82 
 
 
1108 aa  1248  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  60.47 
 
 
551 aa  710  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  59.55 
 
 
1101 aa  1259  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  53.27 
 
 
1088 aa  1089  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  45.81 
 
 
1099 aa  932  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  44.9 
 
 
1105 aa  946  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  52.83 
 
 
1100 aa  1100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  45.51 
 
 
1105 aa  943  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  45.48 
 
 
1098 aa  931  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  64.52 
 
 
553 aa  755  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  45.08 
 
 
1116 aa  923  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  58.68 
 
 
1093 aa  1253  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  49.27 
 
 
1085 aa  965  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  44.78 
 
 
1130 aa  906  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  54.08 
 
 
1088 aa  1094  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  48.68 
 
 
1119 aa  988  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  63.23 
 
 
572 aa  756  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  53.92 
 
 
1088 aa  1108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  60.11 
 
 
1100 aa  1297  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  60.66 
 
 
682 aa  697  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  52.4 
 
 
1094 aa  1037  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  59.82 
 
 
596 aa  681  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  79.73 
 
 
1131 aa  1788  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  51.92 
 
 
1121 aa  1093  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  52.67 
 
 
1088 aa  1057  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  45.54 
 
 
1100 aa  937  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  47.4 
 
 
1098 aa  946  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  51.73 
 
 
1100 aa  1066  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  46.5 
 
 
1112 aa  927  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  91.63 
 
 
1138 aa  2071  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  52.99 
 
 
1102 aa  1107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  94.19 
 
 
1137 aa  2170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  50.87 
 
 
1104 aa  1069  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  48.74 
 
 
1095 aa  984  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  58.69 
 
 
1121 aa  1280  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  44.23 
 
 
1108 aa  864  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  58.58 
 
 
1113 aa  1278  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  58.61 
 
 
556 aa  668  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  59.71 
 
 
606 aa  697  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  57.67 
 
 
1108 aa  1262  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  44.69 
 
 
1110 aa  860  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>