114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5524 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5524  Dyp-type peroxidase family protein  100 
 
 		 293 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3688  Dyp-type peroxidase family protein  98.29 
 
 		 293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.793167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2298  Dyp-type peroxidase  92.15 
 
 		 293 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.427507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4565  Dyp-type peroxidase  89.42 
 
 		 293 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3798  Dyp-type peroxidase family protein  89.42 
 
 		 293 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262927  normal  0.114512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3726  Dyp-type peroxidase family protein  89.42 
 
 		 293 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.747974  normal  0.228519 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4938  Dyp-type peroxidase family protein  89.08 
 
 		 293 aa  531  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0235  dyp-type peroxidase family protein  64.51 
 
 		 396 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0952  dyp-type peroxidase family protein  64.51 
 
 		 414 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0271  dyp-type peroxidase family protein  64.51 
 
 		 417 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0516  dyp-type peroxidase family protein  64.51 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1418  dyp-type peroxidase family protein  64.51 
 
 		 293 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1613  dyp-type peroxidase family protein  64.51 
 
 		 293 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2663  dyp-type peroxidase family protein  64.51 
 
 		 293 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2522  dyp-type peroxidase family protein  64.16 
 
 		 293 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2468  hypothetical protein  62.46 
 
 		 293 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28340  hypothetical protein  61.77 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.569252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0473  Dyp-type peroxidase  56.35 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00060  Dyp-type peroxidase protein  53.47 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3248  Dyp-type peroxidase family  57.24 
 
 		 287 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2514  Dyp-type peroxidase family protein  56.9 
 
 		 287 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2663  Dyp-type peroxidase family protein  57.5 
 
 		 293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2525  Dyp-type peroxidase family protein  53.79 
 
 		 294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  0.073876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2645  Dyp-type peroxidase family protein  55.86 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.366856  normal  0.401961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3166  Dyp-type peroxidase  52.4 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5441  Dyp-type peroxidase family protein  36.21 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4299  Dyp-type peroxidase family  33.33 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.193498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2894  Dyp-type peroxidase  31.77 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  31.14 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2568  dyp-type peroxidase family protein  30.79 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2952  Dyp-type peroxidase family protein  32.78 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.332391 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1230  Dyp-type peroxidase family  30.46 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02331  hypothetical protein  30.46 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02293  hypothetical protein  30.46 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2717  dyp-type peroxidase family protein  30.46 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1248  Dyp-type peroxidase family protein  30.46 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.62141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2586  dyp-type peroxidase family protein  30.46 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2803  dyp-type peroxidase family protein  30.46 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3661  dyp-type peroxidase family protein  30.33 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3278  Dyp-type peroxidase family  29.25 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000160029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3200  Dyp-type peroxidase family  29.25 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0764  Dyp-type peroxidase family  29.59 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03177  hypothetical protein  31.63 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0670  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  30.1 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3310  Dyp-type peroxidase family  30.98 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0143  Dyp-type peroxidase  32.08 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.641407  hitchhiker  0.00262856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0605  Dyp-type peroxidase family protein  29.05 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3223  Dyp-type peroxidase family protein  29.35 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3689  Dyp-type peroxidase family protein  29.05 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1292  Dyp-type peroxidase family protein  29.33 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.465558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3813  Dyp-type peroxidase family protein  29.05 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1399  Dyp-type peroxidase family protein  29.33 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.55791  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3631  Dyp-type peroxidase family  29.05 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  31.06 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3513  Dyp-type peroxidase family protein  29.67 
 
 		 313 aa  119  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2640  Dyp-type peroxidase family  32.23 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2706  Dyp-type peroxidase family  32.23 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2682  Dyp-type peroxidase family  32.23 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2591  dyp-type peroxidase family protein  32.23 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2812  Dyp-type peroxidase family protein  32.23 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3343  Dyp-type peroxidase family protein  29.67 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0610  Dyp-type peroxidase family protein  29.67 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1001  Dyp-type peroxidase family  33.48 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.153616  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4860  Dyp-type peroxidase family protein  30 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445339  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4479  putative melanin biosynthesis protein TyrA  29.47 
 
 		 309 aa  115  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  28.91 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2777  hypothetical protein  28.67 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  28.47 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1043  Dyp-type peroxidase family protein  26.1 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.620298  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3458  Dyp-type peroxidase family protein  29.15 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0740  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  29.1 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  27.76 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0639  Dyp-type peroxidase family protein  28.47 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0493  Dyp-type peroxidase family protein  28.19 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4595  Dyp-type peroxidase family  31.02 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264848  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002803  predicted iron-dependent peroxidase  28.42 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1000  Dyp-type peroxidase family protein  28.47 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5473  Dyp-type peroxidase family protein  30.41 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308432  normal  0.0526287 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1730  Dyp-type peroxidase family protein  26.6 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104157  normal  0.0665076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4562  Dyp-type peroxidase family  31.6 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  26.03 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6414  Dyp-type peroxidase family protein  29.39 
 
 		 349 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285799  normal  0.19542 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5665  Dyp-type peroxidase family protein  29.39 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7089  Dyp-type peroxidase family protein  28.72 
 
 		 359 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264761  normal  0.129458 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10814  hypothetical protein  28.14 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1591  Dyp-type peroxidase family  32.69 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0076  Dyp-type peroxidase family  31.45 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  28.23 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7001  Dyp-type peroxidase  29.05 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5414  Dyp-type peroxidase family protein  29.05 
 
 		 353 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.872456  normal  0.0333574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3201  Dyp-type peroxidase family  29.59 
 
 		 340 aa  99.4  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5572  Dyp-type peroxidase  29.39 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1403  Dyp-type peroxidase  28.72 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6426  Dyp-type peroxidase family protein  28.72 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  30.19 
 
 		 340 aa  96.3  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6187  Dyp-type peroxidase family  32.2 
 
 		 368 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0147  Dyp-type peroxidase family  28.05 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.956863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5715  Dyp-type peroxidase family  28.28 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.93633  normal  0.777307 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3833  Dyp-type peroxidase  29.5 
 
 		 354 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.718236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0389  Dyp-type peroxidase  25.73 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.442459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>