More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5513 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.58 
 
 		 558 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1398  putative methyl-accepting chemotaxis protein  81.98 
 
 		 555 aa  862    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0217  putative methyl-accepting chemotaxis protein  82.08 
 
 		 558 aa  866    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482038  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.64 
 
 		 558 aa  1112    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0772371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2542  methyl-accepting chemotaxis protein  82.05 
 
 		 546 aa  846    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.4 
 
 		 558 aa  995    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0968  methyl-accepting chemotaxis transducer  82.08 
 
 		 558 aa  866    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  93.55 
 
 		 558 aa  1006    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0254  putative methyl-accepting chemotaxis protein  82.05 
 
 		 546 aa  846    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0501  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  81.18 
 
 		 558 aa  885    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1595  putative methyl-accepting chemotaxis protein  81.98 
 
 		 555 aa  862    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.96 
 
 		 558 aa  986    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.32 
 
 		 558 aa  990    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 558 aa  1115    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2687  methyl-accepting chemotaxis protein  82.05 
 
 		 546 aa  846    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.96 
 
 		 558 aa  986    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.253027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.49 
 
 		 541 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3973  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.01 
 
 		 606 aa  552  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259305  normal  0.0136642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1052  chemotaxis sensory transducer  56.34 
 
 		 540 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3653  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  56.83 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.44224  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1488  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.78 
 
 		 540 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159375  normal  0.199661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.74 
 
 		 540 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.138218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.72 
 
 		 540 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1429  putative chemotaxis transducer  56.51 
 
 		 542 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.05 
 
 		 540 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1303  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  55.76 
 
 		 540 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00176405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16430  putative chemotaxis transducer  56.69 
 
 		 542 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.889289  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1493  methyl-accepting chemotaxis protein  55.39 
 
 		 540 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.01 
 
 		 411 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0232938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.7 
 
 		 564 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1462  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.7 
 
 		 564 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1661  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  43.26 
 
 		 622 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1674  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  35.36 
 
 		 696 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.266076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.09 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.73 
 
 		 525 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.09 
 
 		 571 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  27.89 
 
 		 544 aa  169  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 673 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.64 
 
 		 525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.09 
 
 		 519 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.418042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 679 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  29.34 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  23.99 
 
 		 543 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  33.04 
 
 		 541 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.51 
 
 		 541 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.44 
 
 		 557 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 		 661 aa  160  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.09 
 
 		 549 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.33 
 
 		 598 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  33.16 
 
 		 539 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.62 
 
 		 550 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.13 
 
 		 549 aa  156  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.48 
 
 		 547 aa  156  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.69 
 
 		 612 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0159313  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  31.73 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  28.66 
 
 		 549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  28.87 
 
 		 549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.29 
 
 		 541 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.77 
 
 		 540 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0341  methyl-accepting chemotaxis protein  24.72 
 
 		 574 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 		 830 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.16 
 
 		 539 aa  153  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.35 
 
 		 637 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.85 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.62 
 
 		 528 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.03 
 
 		 547 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.99 
 
 		 660 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  28.69 
 
 		 645 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 		 570 aa  151  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  28.93 
 
 		 541 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.94 
 
 		 528 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0086081  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  28.48 
 
 		 543 aa  150  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 		 533 aa  150  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.49 
 
 		 452 aa  150  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 		 474 aa  149  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.87 
 
 		 539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0338  methyl-accepting chemotaxis protein  24.91 
 
 		 574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0832369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 		 542 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 		 666 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1557  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 		 530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.78 
 
 		 539 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.03 
 
 		 537 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 		 807 aa  148  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.26 
 
 		 540 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.86 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.39 
 
 		 533 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.45 
 
 		 674 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  26.88 
 
 		 539 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  26.88 
 
 		 539 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  28.46 
 
 		 660 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.45 
 
 		 542 aa  146  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.11 
 
 		 547 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0355  methyl-accepting chemotaxis protein  25 
 
 		 574 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.43 
 
 		 632 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0369  methyl-accepting chemotaxis protein  25 
 
 		 574 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  28.46 
 
 		 660 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.11 
 
 		 561 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  28.46 
 
 		 660 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.1 
 
 		 512 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000106495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>