119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5446 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  32.26 
 
 
2751 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  32.64 
 
 
2691 aa  658    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  32.92 
 
 
2737 aa  743    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  34.36 
 
 
2536 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  64.12 
 
 
1841 aa  1921    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0157  adhesin HecA  63.49 
 
 
2204 aa  2002    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  100 
 
 
3929 aa  7542    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.6 
 
 
2847 aa  970    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.33 
 
 
2818 aa  964    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.48 
 
 
2666 aa  848    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.44 
 
 
2786 aa  691    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2928  adhesin  39.35 
 
 
1035 aa  414  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2923  hypothetical protein  39.03 
 
 
761 aa  244  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4486  metalloendopeptidase  50.27 
 
 
306 aa  173  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.604115  normal  0.0822021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  34.64 
 
 
6274 aa  171  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  33.66 
 
 
2827 aa  171  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  31.98 
 
 
1489 aa  164  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  31.16 
 
 
5212 aa  161  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  31.89 
 
 
1651 aa  162  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  35.08 
 
 
3443 aa  159  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.63 
 
 
5981 aa  158  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  30.23 
 
 
3552 aa  154  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  33.24 
 
 
2758 aa  154  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.98 
 
 
1730 aa  153  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.2 
 
 
3602 aa  152  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.32 
 
 
3128 aa  151  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  30.65 
 
 
3501 aa  150  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  35.4 
 
 
3563 aa  150  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  35.4 
 
 
594 aa  150  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.77 
 
 
3790 aa  149  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.17 
 
 
3040 aa  148  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  35.02 
 
 
3004 aa  147  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.09 
 
 
658 aa  147  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.2 
 
 
3967 aa  147  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.87 
 
 
3796 aa  146  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  34.2 
 
 
3350 aa  146  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  33.61 
 
 
1998 aa  145  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  34.01 
 
 
3322 aa  145  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  32.46 
 
 
2530 aa  144  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  31.8 
 
 
2588 aa  143  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.68 
 
 
2345 aa  142  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.63 
 
 
3862 aa  142  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.5 
 
 
2421 aa  141  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.65 
 
 
1508 aa  140  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.58 
 
 
2545 aa  140  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  33.82 
 
 
3165 aa  140  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.56 
 
 
1508 aa  139  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.11 
 
 
2600 aa  139  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.1 
 
 
2670 aa  139  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.18 
 
 
3480 aa  139  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.18 
 
 
3378 aa  139  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.18 
 
 
3475 aa  139  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.41 
 
 
3020 aa  137  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.05 
 
 
2782 aa  137  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.37 
 
 
3079 aa  137  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.39 
 
 
1508 aa  135  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7339  adhesin HecA  44.03 
 
 
515 aa  136  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991029  normal  0.53872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.58 
 
 
1508 aa  135  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  31.75 
 
 
3141 aa  131  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  31.75 
 
 
3141 aa  132  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  38.31 
 
 
2984 aa  131  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  33.63 
 
 
3301 aa  129  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  31.52 
 
 
3147 aa  128  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5359  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.03 
 
 
678 aa  128  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.627453 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6763  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.16 
 
 
678 aa  126  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198523  normal  0.504968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  31.03 
 
 
4966 aa  126  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  28.22 
 
 
812 aa  125  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.36 
 
 
1615 aa  124  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  30.02 
 
 
3141 aa  123  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.73 
 
 
3028 aa  122  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  34.39 
 
 
3159 aa  122  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.2 
 
 
3884 aa  122  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  29.93 
 
 
3144 aa  121  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.28 
 
 
1723 aa  121  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  36.36 
 
 
3526 aa  121  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  30.16 
 
 
2449 aa  120  6e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  31.21 
 
 
3131 aa  119  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.8 
 
 
428 aa  117  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.03 
 
 
923 aa  114  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  32 
 
 
716 aa  114  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.41 
 
 
3785 aa  113  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  30.41 
 
 
1618 aa  111  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  31.35 
 
 
1635 aa  109  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  25.9 
 
 
1745 aa  109  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  34.23 
 
 
846 aa  108  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  27.53 
 
 
3081 aa  108  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  27.61 
 
 
898 aa  107  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  27.35 
 
 
905 aa  107  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  27.35 
 
 
905 aa  107  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  27.35 
 
 
911 aa  107  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  31.35 
 
 
1719 aa  107  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  31.17 
 
 
2350 aa  107  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  27.61 
 
 
893 aa  105  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  27.18 
 
 
901 aa  105  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  33.45 
 
 
846 aa  104  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  27 
 
 
914 aa  103  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  30.03 
 
 
1270 aa  103  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5443  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.31 
 
 
730 aa  102  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.34159  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.77 
 
 
721 aa  101  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.05 
 
 
847 aa  100  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>