49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5431 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  100 
 
 
270 aa  544  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  97.78 
 
 
270 aa  527  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  97.04 
 
 
270 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  95.2 
 
 
271 aa  517  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  95.2 
 
 
271 aa  517  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  95.57 
 
 
271 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  66.02 
 
 
281 aa  335  4e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  62.93 
 
 
262 aa  311  5e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  61.81 
 
 
263 aa  311  9e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  61.96 
 
 
262 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  64.35 
 
 
263 aa  309  3e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  63.67 
 
 
271 aa  308  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  58.43 
 
 
254 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  59.3 
 
 
270 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  58.04 
 
 
254 aa  293  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  47.91 
 
 
273 aa  231  7e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0283  YcgL  46.61 
 
 
258 aa  228  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  221  1e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  221  1e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  220  2e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  220  2e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  220  2e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0124  hypothetical protein  44.18 
 
 
259 aa  220  2e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.045429  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  219  4e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  219  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0339  hypothetical protein  41.43 
 
 
263 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  41.04 
 
 
260 aa  215  6e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1192  hypothetical protein  43.87 
 
 
259 aa  213  4e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  hitchhiker  4.8698e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0599  hypothetical protein  42.06 
 
 
258 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  42.86 
 
 
255 aa  198  8e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  41.41 
 
 
237 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  48.46 
 
 
265 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  42.55 
 
 
270 aa  193  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  35.38 
 
 
260 aa  174  1e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  31.52 
 
 
248 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0487  Nucleotidyltransferase, predicted  30.95 
 
 
321 aa  67.8  2e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2851  Nucleotidyltransferase, predicted  29.1 
 
 
358 aa  62.8  6e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  29.73 
 
 
251 aa  61.6  1e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1947  nucleotidyltransferase-like  33.16 
 
 
278 aa  57.4  2e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.685938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  29.3 
 
 
258 aa  55.5  9e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  29.68 
 
 
280 aa  53.9  2e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  34.9 
 
 
256 aa  53.5  3e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  35.56 
 
 
356 aa  52.4  7e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  28.91 
 
 
298 aa  50.4  3e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  33.08 
 
 
364 aa  50.4  3e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  31.95 
 
 
254 aa  50.4  3e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  29.75 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  31.88 
 
 
216 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>