More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5332 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  97.32 
 
 		 672 aa  1158    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2518  DedA family membrane protein  87.2 
 
 		 672 aa  1019    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3923  SNARE associated Golgi protein  85.57 
 
 		 672 aa  995    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  100 
 
 		 672 aa  1301    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  85.42 
 
 		 672 aa  1033    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  79.17 
 
 		 672 aa  975    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  50.4 
 
 		 677 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.72 
 
 		 662 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.23 
 
 		 676 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  34 
 
 		 668 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  34.11 
 
 		 681 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.97 
 
 		 671 aa  259  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  31.32 
 
 		 686 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  29.37 
 
 		 684 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.37 
 
 		 684 aa  188  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  28.89 
 
 		 695 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.24 
 
 		 664 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  29.3 
 
 		 641 aa  171  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  25.9 
 
 		 678 aa  167  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  25.43 
 
 		 678 aa  164  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.33 
 
 		 664 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  24.8 
 
 		 682 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  25.55 
 
 		 682 aa  138  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.4 
 
 		 664 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  21.42 
 
 		 702 aa  110  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  38.41 
 
 		 239 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.79 
 
 		 483 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  43.61 
 
 		 241 aa  104  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  34.15 
 
 		 205 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  30.81 
 
 		 255 aa  99  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  30.81 
 
 		 255 aa  99  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  30.81 
 
 		 255 aa  99  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  35.71 
 
 		 213 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  37.89 
 
 		 173 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  35.58 
 
 		 218 aa  95.5  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  34.39 
 
 		 255 aa  95.5  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  31.92 
 
 		 255 aa  95.1  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  36.05 
 
 		 232 aa  94.7  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  37.2 
 
 		 208 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.32 
 
 		 457 aa  93.2  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  26.91 
 
 		 502 aa  92.8  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  36.97 
 
 		 220 aa  92.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  33.71 
 
 		 176 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  35.5 
 
 		 211 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  40 
 
 		 176 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  28.44 
 
 		 256 aa  91.3  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.98 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  36.36 
 
 		 220 aa  89.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  31.18 
 
 		 256 aa  90.1  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  35.67 
 
 		 173 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  30.25 
 
 		 224 aa  89.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  32.04 
 
 		 215 aa  88.6  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  32.04 
 
 		 215 aa  88.6  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.11 
 
 		 256 aa  88.6  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  24.57 
 
 		 438 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  36.42 
 
 		 176 aa  87.8  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  33.95 
 
 		 176 aa  87.4  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  33.73 
 
 		 176 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  31.69 
 
 		 216 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  31.85 
 
 		 255 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  31.85 
 
 		 255 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  38.41 
 
 		 173 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  38.41 
 
 		 173 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  31.85 
 
 		 255 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  31.85 
 
 		 255 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  31.85 
 
 		 255 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  31.48 
 
 		 176 aa  85.1  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  31.18 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  31.18 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  31.33 
 
 		 254 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 		 254 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  31.33 
 
 		 254 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  33.71 
 
 		 176 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  31.71 
 
 		 176 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  31.33 
 
 		 254 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  31.33 
 
 		 254 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  31.33 
 
 		 254 aa  83.2  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  38.41 
 
 		 173 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.33 
 
 		 254 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.03 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  38.97 
 
 		 173 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  29.1 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  30.07 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  31.95 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  28.74 
 
 		 222 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  29.95 
 
 		 213 aa  79  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  31.33 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  28.32 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  28.32 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  31.95 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  34.81 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  28.32 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  28.99 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  29.14 
 
 		 218 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.14 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  28.8 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  30.52 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  27.33 
 
 		 201 aa  75.1  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>