More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5300 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
205 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  98.05 
 
 
205 aa  410  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  92.2 
 
 
205 aa  387  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  91.71 
 
 
205 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  83.41 
 
 
205 aa  351  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.67 
 
 
210 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3566  glutathione S-transferase domain-containing protein  91.23 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  51.98 
 
 
223 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.78 
 
 
207 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.27 
 
 
207 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.78 
 
 
209 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  41.24 
 
 
210 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.78 
 
 
209 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.29 
 
 
209 aa  148  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.24 
 
 
210 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.51 
 
 
207 aa  147  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.72 
 
 
210 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.72 
 
 
210 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  38.97 
 
 
214 aa  145  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.41 
 
 
211 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.41 
 
 
227 aa  141  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  41.87 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  41.38 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  41.38 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  31.05 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  34.33 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  37.63 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  36.98 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  37.5 
 
 
222 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  32.51 
 
 
186 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  32.37 
 
 
221 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  32.51 
 
 
186 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  35.09 
 
 
216 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.99 
 
 
213 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  36.08 
 
 
222 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  37 
 
 
211 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  35.03 
 
 
207 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2358  Glutathione S-transferase domain protein  34.67 
 
 
205 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.426471  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  34.78 
 
 
213 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.9 
 
 
205 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  36.95 
 
 
184 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  34.48 
 
 
208 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
210 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4773  glutathione S-transferase-like  37.31 
 
 
206 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122319  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.64 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0277  Glutathione S-transferase domain  36.68 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  32.81 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  36.36 
 
 
217 aa  98.2  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  34.72 
 
 
211 aa  98.2  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.12 
 
 
219 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  33.69 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  31.28 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  32.31 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  31.34 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.69 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  32.67 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.03 
 
 
235 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  36.75 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  38.02 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  33.15 
 
 
213 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.1 
 
 
201 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2769  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.94 
 
 
195 aa  94.7  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  31.66 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  35.05 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0016  glutathione S-transferase  34.69 
 
 
207 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  35.23 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  35.23 
 
 
297 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1487  glutathione S-transferase  30.37 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  31.71 
 
 
222 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  35.23 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  35.23 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.99 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.6 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.31 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  35.23 
 
 
266 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  32.02 
 
 
214 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  32.09 
 
 
222 aa  92.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3352  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148422  hitchhiker  0.0000403309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  35.23 
 
 
300 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.96 
 
 
216 aa  92  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2712  glutathione S-transferase-like  34.67 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  34.22 
 
 
211 aa  92  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  31.31 
 
 
205 aa  92  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.22 
 
 
207 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  36.41 
 
 
203 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  29.41 
 
 
222 aa  91.7  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4748  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.06 
 
 
222 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1775  glutathione S-transferase  34.54 
 
 
208 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.87 
 
 
227 aa  91.7  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.43 
 
 
213 aa  91.3  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.66 
 
 
208 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  30.57 
 
 
213 aa  91.3  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.12 
 
 
217 aa  91.3  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.09 
 
 
222 aa  91.3  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  33.66 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  35.71 
 
 
214 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.09 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  34.85 
 
 
225 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>