59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5237 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  97.17 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  91.51 
 
 		 106 aa  201  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  91.51 
 
 		 106 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  90.57 
 
 		 106 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  84.91 
 
 		 106 aa  184  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  75.47 
 
 		 106 aa  167  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  59.05 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  60.95 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  53.4 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  49.52 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  48.39 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  44.55 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  51.72 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  64.38 
 
 		 73 aa  94.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  32.65 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  32.98 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  34.38 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  36.46 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  35.56 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  31.96 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  27.37 
 
 		 96 aa  47.8  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  31.33 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  27.37 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  27.37 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  31.63 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  27.37 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  32 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0458  hypothetical protein  33.75 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42868  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  31.46 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  29.87 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  41.18 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  30.53 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  30.21 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  31.96 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  31.31 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  29.47 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  29.9 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  32.95 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2191  protein of unknown function DUF1330  30.53 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  30.93 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  29.63 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4004  protein of unknown function DUF1330  31.75 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  29.87 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  29.9 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3118  protein of unknown function DUF1330  27.97 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  29.67 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  29.76 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  29.87 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  27.96 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  26.32 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  27.96 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  27.96 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  29.59 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  29.17 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  32.65 
 
 		 102 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  32.65 
 
 		 102 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  32.65 
 
 		 102 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>