95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5205 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 
85 aa  171  3e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  4.29039e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  97.65 
 
 
85 aa  166  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  70.93 
 
 
90 aa  112  2e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  62.79 
 
 
87 aa  107  7e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  58.62 
 
 
87 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  58.62 
 
 
87 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  58.62 
 
 
87 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  60.47 
 
 
87 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  59.3 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  59.3 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  59.3 
 
 
87 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  59.3 
 
 
87 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  57.47 
 
 
87 aa  95.9  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  47.56 
 
 
86 aa  76.6  1e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  47.67 
 
 
88 aa  71.2  4e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  45.57 
 
 
453 aa  71.2  4e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4517  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 
86 aa  69.3  1e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  47.44 
 
 
101 aa  67.8  5e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  47.44 
 
 
88 aa  67.4  7e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  47.44 
 
 
88 aa  67.4  7e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  43.9 
 
 
86 aa  66.2  1e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  49.38 
 
 
88 aa  65.1  3e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  45.35 
 
 
88 aa  65.1  3e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0004  PAAR repeat-containing protein  46.58 
 
 
134 aa  65.1  3e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0248137  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  43.84 
 
 
88 aa  63.5  1e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  48.24 
 
 
87 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  43.9 
 
 
88 aa  61.6  3e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  43.9 
 
 
88 aa  61.6  3e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  43.9 
 
 
88 aa  61.6  3e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  42.5 
 
 
188 aa  62  3e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  43.9 
 
 
88 aa  62  3e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  43.9 
 
 
88 aa  61.6  3e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  43.9 
 
 
88 aa  61.6  3e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  43.9 
 
 
88 aa  61.6  3e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  43.9 
 
 
83 aa  60.5  8e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  46.84 
 
 
87 aa  60.5  8e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  43.9 
 
 
83 aa  60.1  1e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  42.68 
 
 
83 aa  60.1  1e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  44.87 
 
 
86 aa  58.2  4e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  39.02 
 
 
87 aa  57.8  5e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  39.02 
 
 
102 aa  57.8  6e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  40.74 
 
 
89 aa  57.8  6e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  40.74 
 
 
194 aa  57.4  7e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  41.38 
 
 
89 aa  57.4  7e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  42.68 
 
 
83 aa  56.6  1e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  43.04 
 
 
88 aa  56.6  1e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  42.68 
 
 
83 aa  55.8  2e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  43.75 
 
 
88 aa  55.5  3e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0016  PAAR  41.46 
 
 
86 aa  54.7  4e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  46.67 
 
 
137 aa  54.7  4e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  37.35 
 
 
93 aa  55.1  4e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  41.46 
 
 
83 aa  54.3  6e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  39.02 
 
 
92 aa  53.5  8e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  39.74 
 
 
88 aa  53.1  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  40.26 
 
 
87 aa  53.1  1e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1796  PAAR repeat-containing protein  36.9 
 
 
85 aa  52.4  2e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.618362 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  40.96 
 
 
84 aa  52.4  2e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  37.8 
 
 
94 aa  52  3e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  35.71 
 
 
94 aa  51.2  5e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  34.18 
 
 
93 aa  50.8  6e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  40.48 
 
 
91 aa  50.4  8e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3180  hypothetical protein  41.33 
 
 
84 aa  50.1  1e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.137745 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  43.06 
 
 
133 aa  48.9  2e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  38.96 
 
 
175 aa  49.3  2e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  39.24 
 
 
87 aa  49.3  2e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  39.24 
 
 
87 aa  49.3  2e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  37.18 
 
 
86 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  39.24 
 
 
87 aa  49.3  2e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  37.97 
 
 
173 aa  48.1  4e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  45.68 
 
 
85 aa  47.4  7e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  38.27 
 
 
175 aa  47  9e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  38.27 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  32.91 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  35.06 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  30.38 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  36.71 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  43.21 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  43.21 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  38.2 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0441  hypothetical protein  39.47 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  36.25 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  40.54 
 
 
177 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  45.28 
 
 
179 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  5.63624e-08  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  38.67 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  37.04 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  37.04 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  37.8 
 
 
141 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4102  hypothetical protein  40.51 
 
 
107 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  38.27 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  41.82 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  43.64 
 
 
181 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  37.04 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  38.89 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  38.78 
 
 
84 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  40.35 
 
 
481 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>