More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5116 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  50.56 
 
 		 746 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  54.47 
 
 		 751 aa  756    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  50.56 
 
 		 746 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  50.7 
 
 		 746 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  48.25 
 
 		 745 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  51.11 
 
 		 746 aa  673    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  100 
 
 		 755 aa  1516    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  48.11 
 
 		 745 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  45.69 
 
 		 746 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  47.83 
 
 		 745 aa  628  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  45.52 
 
 		 747 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  47.77 
 
 		 747 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  47.47 
 
 		 747 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  44.46 
 
 		 748 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  47.38 
 
 		 764 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  44.01 
 
 		 746 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  44.51 
 
 		 755 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  42.21 
 
 		 750 aa  582  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  42.31 
 
 		 740 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  41.24 
 
 		 740 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  43.37 
 
 		 734 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  40.97 
 
 		 740 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  42.72 
 
 		 757 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.3 
 
 		 726 aa  532  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  39.83 
 
 		 747 aa  522  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  40.19 
 
 		 744 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  39.23 
 
 		 764 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  40.72 
 
 		 736 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  40.94 
 
 		 736 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  38.3 
 
 		 741 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  40.11 
 
 		 744 aa  485  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  40.97 
 
 		 747 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  41.29 
 
 		 745 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  39.12 
 
 		 744 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  38.62 
 
 		 726 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  41.33 
 
 		 746 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  37.45 
 
 		 759 aa  467  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  37.27 
 
 		 723 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4097  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.32 
 
 		 760 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  40.76 
 
 		 760 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  40.11 
 
 		 730 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  40.14 
 
 		 749 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.85 
 
 		 741 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  38.67 
 
 		 740 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  41.38 
 
 		 755 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  37.57 
 
 		 741 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  37.99 
 
 		 741 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  38.15 
 
 		 739 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  38.15 
 
 		 739 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  38.28 
 
 		 739 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  38.56 
 
 		 739 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  37.41 
 
 		 741 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.88 
 
 		 741 aa  452  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.41 
 
 		 741 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  37.41 
 
 		 741 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  36.2 
 
 		 721 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  36.62 
 
 		 724 aa  435  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  36.04 
 
 		 734 aa  432  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  37.78 
 
 		 732 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  36.1 
 
 		 716 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  35.07 
 
 		 735 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  36.6 
 
 		 719 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  36.33 
 
 		 720 aa  425  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  37.69 
 
 		 740 aa  426  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  35.34 
 
 		 723 aa  425  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  36.46 
 
 		 719 aa  426  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  36.46 
 
 		 719 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  36.46 
 
 		 719 aa  426  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  36.05 
 
 		 720 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  36.05 
 
 		 720 aa  422  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  36.05 
 
 		 720 aa  422  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  34.95 
 
 		 753 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  36.05 
 
 		 720 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.49 
 
 		 730 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  35.92 
 
 		 720 aa  422  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  36.46 
 
 		 719 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  36.05 
 
 		 720 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  35.77 
 
 		 720 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  35.91 
 
 		 720 aa  419  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  35.38 
 
 		 731 aa  413  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  35.09 
 
 		 727 aa  405  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.38 
 
 		 736 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  32.92 
 
 		 724 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  39.31 
 
 		 754 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  36.71 
 
 		 745 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  37.6 
 
 		 721 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  33.08 
 
 		 802 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.79 
 
 		 726 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  33.79 
 
 		 726 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  33.01 
 
 		 722 aa  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.79 
 
 		 726 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.79 
 
 		 726 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.79 
 
 		 726 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  33.79 
 
 		 726 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.79 
 
 		 726 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.79 
 
 		 726 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  33.87 
 
 		 784 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  31.84 
 
 		 726 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.65 
 
 		 800 aa  353  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.73 
 
 		 780 aa  350  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>