More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5107 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  100 
 
 		 345 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  94.2 
 
 		 450 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  83.14 
 
 		 457 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  82.61 
 
 		 457 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  82.61 
 
 		 457 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  76.85 
 
 		 454 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  48.32 
 
 		 471 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  48.32 
 
 		 512 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  48.32 
 
 		 472 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  48.32 
 
 		 470 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  48.32 
 
 		 509 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  47.99 
 
 		 499 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  44.74 
 
 		 420 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  46.42 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  45.61 
 
 		 421 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  46.96 
 
 		 412 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  45.26 
 
 		 421 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  42.9 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  45.27 
 
 		 425 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  39.6 
 
 		 464 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  42.44 
 
 		 446 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  38.8 
 
 		 464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  38.7 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  38.7 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  38.82 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  36.96 
 
 		 465 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  37.69 
 
 		 464 aa  156  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  38.43 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  39.18 
 
 		 464 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  37.64 
 
 		 460 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  36.51 
 
 		 491 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  38.63 
 
 		 457 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  34.19 
 
 		 569 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  32.16 
 
 		 687 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  36.65 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  32.93 
 
 		 460 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  39.33 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  35.58 
 
 		 465 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  40.23 
 
 		 457 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  40.23 
 
 		 457 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  42.94 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  35.92 
 
 		 695 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  33.08 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  35.44 
 
 		 479 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  35.77 
 
 		 448 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  35.6 
 
 		 490 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  40.54 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35 
 
 		 441 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  42.37 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  36.48 
 
 		 741 aa  137  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  37.93 
 
 		 473 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  44.72 
 
 		 386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  33 
 
 		 449 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  32.52 
 
 		 676 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  37.93 
 
 		 475 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  37.93 
 
 		 473 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  31.12 
 
 		 680 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  36.18 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  37.5 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  30.42 
 
 		 681 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  33.61 
 
 		 646 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.57 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  36.64 
 
 		 438 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  47.59 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  35.25 
 
 		 472 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  31.07 
 
 		 665 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  33.53 
 
 		 459 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  30.97 
 
 		 477 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  34.44 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  36.21 
 
 		 503 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  31.58 
 
 		 465 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  34.19 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  37.65 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  37.5 
 
 		 468 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  36.52 
 
 		 475 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  38.4 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  31.97 
 
 		 523 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  33.92 
 
 		 513 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  40.7 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  37.5 
 
 		 447 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  30.22 
 
 		 477 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  34.16 
 
 		 690 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  34.78 
 
 		 480 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  35.36 
 
 		 490 aa  126  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  32.49 
 
 		 417 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  36.16 
 
 		 577 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  36.16 
 
 		 577 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  34.14 
 
 		 656 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  33.06 
 
 		 695 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  33.74 
 
 		 692 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  38.82 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  35.86 
 
 		 437 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  36.52 
 
 		 464 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  42.86 
 
 		 402 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  32.68 
 
 		 640 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  35.19 
 
 		 645 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  35.06 
 
 		 482 aa  123  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  32.79 
 
 		 441 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  37.29 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  33.58 
 
 		 681 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>