109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5077 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
236 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  94.64 
 
 
224 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  94.2 
 
 
224 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  92.41 
 
 
224 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  92.41 
 
 
224 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  90.62 
 
 
224 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  85.17 
 
 
236 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  71.88 
 
 
224 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  71.88 
 
 
224 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  60.18 
 
 
225 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  41.55 
 
 
225 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  44.44 
 
 
224 aa  174  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  43.16 
 
 
223 aa  174  1e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  43.16 
 
 
223 aa  174  1e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  38.53 
 
 
224 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  42.49 
 
 
222 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.64 
 
 
222 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.89 
 
 
224 aa  166  3e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  40.34 
 
 
224 aa  162  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  41.92 
 
 
222 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  41.74 
 
 
224 aa  158  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
224 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
271 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  38.72 
 
 
227 aa  147  2e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  37.71 
 
 
236 aa  128  8e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  35.56 
 
 
236 aa  127  1e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 
288 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  36.86 
 
 
236 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  36 
 
 
236 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 
244 aa  121  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
218 aa  120  2e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.22 
 
 
236 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  36.93 
 
 
236 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 
232 aa  115  4e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 
236 aa  115  7e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  34.82 
 
 
229 aa  114  9e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 
234 aa  114  2e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  33.62 
 
 
238 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.05 
 
 
236 aa  110  2e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  31.91 
 
 
236 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 
234 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 
230 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 
235 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  32.88 
 
 
229 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  31.96 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  31.96 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  31.96 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  31.96 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  31.96 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  31.96 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  31.96 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
223 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  29.65 
 
 
220 aa  83.6  3e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 
211 aa  80.9  1e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  24.4 
 
 
250 aa  67  3e-10  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  25.59 
 
 
244 aa  63.9  2e-09  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 
231 aa  62.4  6e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 
209 aa  56.6  3e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
228 aa  50.1  3e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  34.69 
 
 
207 aa  50.4  3e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  34.04 
 
 
249 aa  49.3  5e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  32.97 
 
 
207 aa  48.5  8e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  26.18 
 
 
231 aa  48.5  9e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 
236 aa  48.5  9e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  32.98 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  32.97 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  32.65 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  28.87 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  27.96 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  34.07 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.06 
 
 
157 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2469  hypothetical protein  30.94 
 
 
166 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  29 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 
202 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
237 aa  45.4  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  36.17 
 
 
157 aa  45.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  27.66 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  30.11 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.23 
 
 
177 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  29.7 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 
411 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.51 
 
 
427 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  38.03 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  30.85 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.62 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  28.41 
 
 
248 aa  43.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.62 
 
 
158 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  27.03 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1985  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0092  phosphoglycerate mutase family protein  23.87 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  29.7 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  29.7 
 
 
247 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  24.89 
 
 
223 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  29.79 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 
293 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.48 
 
 
166 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>