240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5032 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  95.36 
 
 		 237 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  60.66 
 
 		 229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.03 
 
 		 232 aa  248  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0419  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.52 
 
 		 209 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.41 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  52.86 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  51.83 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  50.92 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  47.09 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.71 
 
 		 235 aa  204  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  50 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.79 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  39.83 
 
 		 261 aa  194  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  45.41 
 
 		 254 aa  189  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  44.29 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  43.04 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  42.13 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  45.5 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  46.51 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  43.17 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.86 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  43.17 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.45 
 
 		 227 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  41.78 
 
 		 220 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2964  ThiJ/PfpI domain protein  40.09 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  40.74 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  37 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  37 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  37.33 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  37 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  40.85 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  42.41 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  41.31 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  41.31 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.92 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  37.33 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  40.85 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.91 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.33 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  36.87 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  36.87 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  41.07 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.45 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  40.45 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.91 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  38.57 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.91 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.48 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.52 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  40.38 
 
 		 220 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  43.19 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  43.93 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.55 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  39.64 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  37.56 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  39.44 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2504  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.62 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2650  ThiJ/PfpI  39.35 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  45 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.7 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.09 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  40.09 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3438  intracellular protease/amidase-like  37.23 
 
 		 366 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  44.02 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  39.91 
 
 		 225 aa  158  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.21 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.19 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.41 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  40.99 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.31 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3431  ThiJ/PfpI domain protein  37.61 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.81 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  39.91 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  39.29 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  43.54 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  40.45 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  36.44 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  38.5 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  37.9 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.79 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.85 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  40.27 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  40.62 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  41.78 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  40.89 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  38.05 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.07 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  37.95 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  39.29 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  39.29 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  39.29 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  39.29 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  39.29 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  39.29 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  39.29 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  38.18 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  35.56 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  38.18 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>