203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4986 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  100 
 
 
273 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  97.07 
 
 
273 aa  515  1e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  94.14 
 
 
273 aa  516  1e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  94.14 
 
 
273 aa  516  1e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  93.04 
 
 
273 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  92.31 
 
 
273 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  85.77 
 
 
270 aa  468  1e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  71.17 
 
 
275 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  71.53 
 
 
275 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  71.53 
 
 
275 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  71.53 
 
 
275 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  71.53 
 
 
275 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  71.53 
 
 
275 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  71.53 
 
 
275 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  71.53 
 
 
275 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  66.91 
 
 
283 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  66.54 
 
 
275 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  67.67 
 
 
278 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  63.74 
 
 
270 aa  336  2e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  60.15 
 
 
281 aa  315  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  50.37 
 
 
279 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  45.22 
 
 
271 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  48.06 
 
 
255 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  47.67 
 
 
255 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  46.01 
 
 
261 aa  214  1e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  44.36 
 
 
270 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  43.18 
 
 
253 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  43.18 
 
 
253 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  42.8 
 
 
253 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  41.98 
 
 
252 aa  184  2e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  41.86 
 
 
265 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  40.88 
 
 
617 aa  175  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  40.62 
 
 
288 aa  174  1e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  38.7 
 
 
304 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  43.5 
 
 
247 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  42.28 
 
 
348 aa  165  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  39.39 
 
 
284 aa  164  2e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  38.72 
 
 
273 aa  162  5e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  39.52 
 
 
291 aa  162  8e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2173  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  41 
 
 
256 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0791652  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  39.43 
 
 
281 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.43 
 
 
256 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  37.79 
 
 
311 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  38.46 
 
 
290 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3474  siderophore-interacting protein  37.83 
 
 
255 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  38.65 
 
 
366 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3524  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  39.08 
 
 
254 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.326071  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3400  siderophore-interacting protein  40 
 
 
255 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3404  siderophore-interacting protein  36.98 
 
 
255 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3570  siderophore-interacting protein  37.45 
 
 
255 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.416656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3508  siderophore-interacting protein  37.45 
 
 
255 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.66465e-13 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  42.21 
 
 
280 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3251  siderophore-interacting protein  36.64 
 
 
254 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  38.15 
 
 
277 aa  147  1e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  38.11 
 
 
274 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3364  siderophore-interacting protein  36.26 
 
 
254 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0792017  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3506  siderophore-interacting protein  36.26 
 
 
254 aa  146  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.960559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3535  siderophore-interacting protein  36.26 
 
 
254 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0880891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4383  siderophore-interacting protein  36.26 
 
 
254 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347587  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  37.5 
 
 
278 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0631  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.88 
 
 
254 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.231291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.88 
 
 
254 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  37.45 
 
 
361 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  38.21 
 
 
289 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  38.87 
 
 
275 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  39.68 
 
 
272 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  36.8 
 
 
623 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02889  hypothetical protein  35.88 
 
 
254 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02939  predicted siderophore interacting protein  35.88 
 
 
254 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  39.84 
 
 
267 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  37.74 
 
 
370 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  40.65 
 
 
297 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  38.93 
 
 
277 aa  137  3e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  38.15 
 
 
277 aa  134  2e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  36.03 
 
 
248 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  36.03 
 
 
250 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.35 
 
 
274 aa  132  7e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  36.03 
 
 
248 aa  130  2e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2573  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.24 
 
 
267 aa  130  2e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.55 
 
 
279 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  35.69 
 
 
271 aa  129  4e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  35.63 
 
 
250 aa  129  5e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  35.22 
 
 
251 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.22 
 
 
247 aa  128  8e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2266  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.65 
 
 
267 aa  127  1e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  34.82 
 
 
250 aa  127  2e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  35.22 
 
 
252 aa  127  2e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  35.79 
 
 
340 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  5.30029e-05 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  32.56 
 
 
295 aa  126  4e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.472238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  34.41 
 
 
277 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  35.42 
 
 
276 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.84 
 
 
272 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  39.02 
 
 
266 aa  122  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.26 
 
 
289 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  35.02 
 
 
259 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  31.45 
 
 
247 aa  120  2e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  34.92 
 
 
274 aa  120  2e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3539  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.92 
 
 
268 aa  120  2e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3561  Siderophore-interacting protein  38.8 
 
 
283 aa  120  2e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2259  FAD-binding 9, siderophore-interacting  30.95 
 
 
254 aa  119  5e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>