More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4945 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  93.9 
 
 
460 aa  877    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  79.87 
 
 
466 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  79.87 
 
 
466 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  79.65 
 
 
466 aa  743    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  80.09 
 
 
466 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  80.09 
 
 
466 aa  747    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  80.09 
 
 
466 aa  748    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  93.9 
 
 
461 aa  879    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  79.87 
 
 
466 aa  745    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  81.92 
 
 
470 aa  764    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  92.59 
 
 
459 aa  865    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.15 
 
 
471 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  73.46 
 
 
469 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  94.12 
 
 
480 aa  879    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.13 
 
 
459 aa  920    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
459 aa  927    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.74 
 
 
486 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  94.12 
 
 
480 aa  879    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.49 
 
 
471 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.51 
 
 
475 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  52.74 
 
 
481 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  52.75 
 
 
456 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  51.58 
 
 
488 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.79 
 
 
488 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  50.43 
 
 
456 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  51.39 
 
 
487 aa  418  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.11 
 
 
478 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 
477 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  45.71 
 
 
501 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  46.62 
 
 
458 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.49 
 
 
449 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  45.27 
 
 
470 aa  362  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  41.83 
 
 
461 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
461 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  44.02 
 
 
467 aa  342  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  40.79 
 
 
459 aa  336  5.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
485 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  39.06 
 
 
451 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
464 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  35.23 
 
 
483 aa  303  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
447 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  39.13 
 
 
456 aa  298  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  36.8 
 
 
467 aa  297  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  37.94 
 
 
451 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
474 aa  295  9e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
480 aa  286  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
469 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  40.57 
 
 
287 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 
564 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  33.04 
 
 
564 aa  147  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
695 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  37.5 
 
 
387 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  39.37 
 
 
447 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  38.18 
 
 
392 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  37.12 
 
 
497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
770 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  38.38 
 
 
373 aa  132  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  34.86 
 
 
388 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  35.62 
 
 
391 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  34.91 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  27.94 
 
 
553 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  37.06 
 
 
557 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  28.94 
 
 
553 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
535 aa  126  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  37.73 
 
 
489 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  40.64 
 
 
395 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 
584 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
490 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
1229 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0122  methyl-accepting chemotaxis protein  30.43 
 
 
553 aa  124  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  35.78 
 
 
1226 aa  123  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
561 aa  123  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  35.5 
 
 
1101 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
748 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.44 
 
 
383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  39.38 
 
 
662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
771 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  38.43 
 
 
640 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.88 
 
 
563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
662 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  34.58 
 
 
525 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  33.21 
 
 
518 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  35.78 
 
 
783 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  32.92 
 
 
632 aa  120  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  35.8 
 
 
687 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  38.03 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  35.96 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  38.03 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  36.67 
 
 
619 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
700 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  40.37 
 
 
296 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  36.67 
 
 
680 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
658 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  31.9 
 
 
585 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
598 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>