More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4932 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  98.09 
 
 		 419 aa  849    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  96.67 
 
 		 420 aa  815    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  94.03 
 
 		 419 aa  780    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 419 aa  863    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  96.67 
 
 		 420 aa  815    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  99.05 
 
 		 419 aa  854    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  84.32 
 
 		 421 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  85.57 
 
 		 417 aa  720    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  62.91 
 
 		 412 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  62.91 
 
 		 412 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  62.63 
 
 		 412 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  62.63 
 
 		 412 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  45.77 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  45.05 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  45.15 
 
 		 410 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  41.54 
 
 		 417 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  41.5 
 
 		 417 aa  319  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  41.31 
 
 		 413 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  43.52 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  41.31 
 
 		 399 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  41.77 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  38.86 
 
 		 414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  38.52 
 
 		 414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.41 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  38.27 
 
 		 420 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  37.89 
 
 		 424 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  37.65 
 
 		 424 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  30.65 
 
 		 441 aa  204  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 		 432 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  29.86 
 
 		 427 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  31.04 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  29.4 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 445 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  31.6 
 
 		 495 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  32.43 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.93 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 441 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 424 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 448 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 419 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.48 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 452 aa  103  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 433 aa  103  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  30.3 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  33.19 
 
 		 434 aa  97.1  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 428 aa  97.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 		 434 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 431 aa  96.3  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 444 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 418 aa  93.6  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  34.73 
 
 		 435 aa  93.2  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 441 aa  92.8  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  29.75 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.41 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 442 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 466 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.12 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 424 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 422 aa  87  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 		 431 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1317  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.84 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.83 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>