44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4881 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4881  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like protein  100 
 
 		 117 aa  237  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290498  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5429  DOPA 45-dioxygenase  98.28 
 
 		 117 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0102  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like  89.74 
 
 		 136 aa  216  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5557  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like protein  88.03 
 
 		 117 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5303  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like protein  88.03 
 
 		 117 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4715  DOPA 45-dioxygenase  88.03 
 
 		 117 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3249  DOPA 45-dioxygenase  81.9 
 
 		 117 aa  193  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2245  hypothetical protein  73.91 
 
 		 117 aa  184  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.68606  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3057  hypothetical protein  71.3 
 
 		 117 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1270  hypothetical protein  71.3 
 
 		 117 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0983  hypothetical protein  71.3 
 
 		 117 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917936  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2932  hypothetical protein  71.3 
 
 		 117 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2245  hypothetical protein  71.3 
 
 		 117 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1288  DOPA 4,5-dioxygenase  71.3 
 
 		 117 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1964  hypothetical protein  71.3 
 
 		 117 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5451  DOPA 45-dioxygenase  67.57 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0418054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7107  Dopa 45-dioxygenase  67.83 
 
 		 116 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0224  putative dioxygenase  67.83 
 
 		 116 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2138  Dopa 45-dioxygenase  47.83 
 
 		 116 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0163  hypothetical protein  46.79 
 
 		 110 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233913  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0081  hypothetical protein  43.59 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.000339661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2658  DOPA-dioxygenase-like  45.05 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00410  putative dioxygenase  45.22 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0096  DOPA 4,5-dioxygenase  45.45 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0035  dopa 4,5-dioxygenase  43.48 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3216  hypothetical protein  48.51 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0096  DOPA 45-dioxygenase  44.55 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000400546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0099  DOPA 45-dioxygenase  45.45 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000561986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3138  hypothetical protein  43.75 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.471828  decreased coverage  0.00930888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2296  Dopa 45-dioxygenase  49.51 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1425  DOPA 45-dioxygenase  44.44 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.509648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0029  hypothetical protein  43.81 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.313279  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1688  Dopa 45-dioxygenase  46.08 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1678  hypothetical protein  39.42 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0838  hypothetical protein  39.18 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2621  hypothetical protein  37.62 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3645  Dopa 45-dioxygenase  39.05 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0614  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like protein  36.44 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.412688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05556  4,5-dioxygenase  28.12 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001586  aromatic ring-cleaving dioxygenase  29.17 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0315  hypothetical protein  33.66 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04806  conserved hypothetical protein  37.14 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.612682 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30848  predicted protein  31.09 
 
 		 178 aa  52.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.91244 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29052  predicted protein  29.63 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>