21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4786 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4786  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  699  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  3.05274e-07  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3703  hypothetical protein  38.67 
 
 
351 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0375  hypothetical protein  38.17 
 
 
341 aa  249  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2938  hypothetical protein  39.88 
 
 
347 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2822  hypothetical protein  38.48 
 
 
341 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154965  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4502  hypothetical protein  38.14 
 
 
334 aa  238  7e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1471  hypothetical protein  38.86 
 
 
340 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1479  hypothetical protein  38.76 
 
 
340 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206358  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1310  hypothetical protein  32.04 
 
 
359 aa  130  4e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2837  hypothetical protein  27.97 
 
 
332 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1406  hypothetical protein  29.9 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211939  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4317  hypothetical protein  29.55 
 
 
336 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00276005  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1047  hypothetical protein  29.89 
 
 
337 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4405  hypothetical protein  30.25 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996457  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0406  hypothetical protein  27.19 
 
 
334 aa  87  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.953246  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4098  hypothetical protein  27.46 
 
 
347 aa  82.4  1e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  5.00149e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0779  hypothetical protein  24.92 
 
 
329 aa  82  1e-14  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1476  hypothetical protein  26.44 
 
 
323 aa  78.6  1e-13  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00768599  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1116  hypothetical protein  25.61 
 
 
346 aa  77  5e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3551  hypothetical protein  25 
 
 
258 aa  71.6  2e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2707  hypothetical protein  26.3 
 
 
362 aa  66.6  6e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  1.34366e-05  hitchhiker  0.00145883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>