More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4548 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  99.72 
 
 		 357 aa  723    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  88.7 
 
 		 360 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  94.96 
 
 		 360 aa  693    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  95.51 
 
 		 356 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  93.52 
 
 		 355 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  94.96 
 
 		 357 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  94.68 
 
 		 360 aa  690    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 357 aa  726    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  88.08 
 
 		 393 aa  628  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  88.3 
 
 		 462 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  89.52 
 
 		 387 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  89.25 
 
 		 410 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  89.25 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  89.25 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  85.03 
 
 		 361 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  83.04 
 
 		 360 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  81.55 
 
 		 360 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  74.92 
 
 		 350 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  73.16 
 
 		 338 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2953  helix-turn-helix domain-containing protein  44.21 
 
 		 349 aa  285  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0872  AraC family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 382 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2118  HTH-type transcriptional regulator  42.34 
 
 		 328 aa  272  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  41.92 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  40.99 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  38.08 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7250  transcriptional regulator AraC family  37.72 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1392  transcriptional regulator  38.22 
 
 		 339 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.683187  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4575  transcriptional regulator  37.73 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3159  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2210  AraC family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2481  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 331 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25538 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3514  transcriptional regulator  34.66 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3564  AraC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2357  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0307  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.96292  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0814  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0400  AraC family transcriptional regulator  34.37 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0321  AraC family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.5557  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 351 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3921  transcriptional regulator, AraC family  30.79 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.441659  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  33.02 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  31.27 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 367 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 332 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0827  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  33.44 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1007  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1980  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3767  transcriptional regulator  29.14 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2105  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1001  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  30.79 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  30.79 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  30.37 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  29.2 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>