226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4507 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5187  glycosyl transferase family protein  86.86 
 
 
429 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00893984  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0558  glycosyl transferase family protein  86.44 
 
 
427 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3273  glycosyl transferase family protein  87.83 
 
 
427 aa  698    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0719433  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
427 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  97.19 
 
 
427 aa  798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5095  glycosyl transferase family protein  88.08 
 
 
427 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509328  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0373  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.56 
 
 
439 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00103797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0812  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.56 
 
 
439 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000142515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1919  rhamnosyl transferase  71.56 
 
 
439 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000883643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0725  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.56 
 
 
439 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1832  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.56 
 
 
439 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2095  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.56 
 
 
439 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000117382  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0460  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.33 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.276581  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0921  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.33 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0461  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.33 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0722  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.33 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000236026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0185  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.33 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1019  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.33 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1421  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.33 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1993  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.33 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1076  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.81 
 
 
475 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000121817  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1880  rhamnosyltransferase I, subunit B  71.81 
 
 
475 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000550735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1648  rhamnosyltransferase chain B  46.7 
 
 
426 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19110  rhamnosyltransferase chain B  46.1 
 
 
426 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2480  glycosyl transferase family 28  36.36 
 
 
416 aa  266  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1457  glycosyl transferase family 28  36.16 
 
 
415 aa  260  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4922  glycosyl transferase family protein  36.01 
 
 
435 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  40.56 
 
 
419 aa  243  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  36.24 
 
 
416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2036  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6794  glycosyl transferase family 28  36.24 
 
 
412 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4779  glycosyl transferase family 28  31.98 
 
 
418 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.514672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2409  glycosyl transferase family 28  34.86 
 
 
420 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2090  glycosyl transferase family 28  35.9 
 
 
424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2132  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
420 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1906  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1905  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
410 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1800  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0057  glycosyl transferase family 28  27.17 
 
 
427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4758  glycosyl transferase family 28  28.57 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2526  glycosyl transferase family 28  34.75 
 
 
412 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00117943  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2291  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  32.05 
 
 
415 aa  110  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0972144  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2048  glycosyl transferase family 28  29.1 
 
 
425 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0485  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
451 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.716398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3732  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
444 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.303192  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8827  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  31.69 
 
 
405 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177267  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11557  glycosyltransferase  26.93 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3115  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3175  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.617571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0362  sterol 3-beta-glucosyltransferase  29.01 
 
 
417 aa  96.3  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0442187  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0009  glycosyl transferase family 28  28.8 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.463057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2034  hypothetical protein  26.81 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.906883  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1350  glycosyl transferase family 28  29.54 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.0669225 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00487  sterol glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04880)  26.62 
 
 
749 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4841  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  27.64 
 
 
443 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2593  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
412 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3714  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  24.94 
 
 
422 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5814  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
407 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_93762  predicted protein  30.75 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10600  glycosyl transferase, UDP-glucuronosyltransferase  24.78 
 
 
425 aa  89  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2083  sterol 3-beta-glucosyltransferase  27.23 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0177  sterol 3-beta-glucosyltransferase  27.64 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3605  sterol 3-beta-glucosyltransferase  30.38 
 
 
413 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5942  glycosyl transferase family 28  27.53 
 
 
413 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547483  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5179  glycosyl transferase  32.79 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2652  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.8 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00514492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2894  sterol 3-beta-glucosyltransferase  29.54 
 
 
435 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1700  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125304  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2852  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5461  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3101  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.61797  normal  0.564364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2387  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3800  sterol 3-beta-glucosyltransferase  30.19 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.306929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5063  UDP-glycosyltransferase, MGT  29.2 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2103  glycosyltransferase family 28 protein  29.02 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646286  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1037  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  27.27 
 
 
462 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0168  sterol 3-beta-glucosyltransferase  28.05 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.398755  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11559  glycosyltransferase  25.81 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_191  Sterol 3-beta-glucosyltransferase (Autophagy-related protein 26) (UDP-glycosyltransferase 51)  25.74 
 
 
1249 aa  78.2  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8226  hypothetical protein  23.25 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0373  sterol 3-beta-glucosyltransferase  26.55 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6314  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1765  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1778  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.72129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0113  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  28.77 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.015765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0690  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  23.45 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0718  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  23.45 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194717  normal  0.0259108 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_1174  predicted protein  25.06 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03260  sterol 3-beta-glucosyltransferase, putative  23.88 
 
 
1220 aa  72.8  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4642  glycosyl transferase family protein  28.54 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3721  glycosyl transferase family protein  28.54 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4524  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.186857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3248  glycosyltransferase, MGT family  40 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3043  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  41.32 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000372483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3452  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3283  glycosyltransferase, MGT family  23.67 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5223  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0184372  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4844  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  27.31 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  31.2 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3114  Glycosyl transferase-like UDP- glucuronosyltransferase  29.3 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.826951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>