More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4500 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  78.13 
 
 		 479 aa  759    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5025  transcriptional regulator  98.94 
 
 		 472 aa  947    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  84.45 
 
 		 478 aa  811    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  82.84 
 
 		 473 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  83.61 
 
 		 478 aa  806    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4500  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 472 aa  955    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.705718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  83.61 
 
 		 478 aa  806    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  55.04 
 
 		 483 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.73 
 
 		 483 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  54.51 
 
 		 500 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 471 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 487 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  52.65 
 
 		 477 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  52.03 
 
 		 469 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  52.33 
 
 		 477 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  52.44 
 
 		 477 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.64 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 477 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 477 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  52.09 
 
 		 483 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 491 aa  477  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5785  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.01 
 
 		 483 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  51.61 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6902  transcriptional regulator  53.68 
 
 		 488 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  50.32 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 493 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 493 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 491 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 493 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 493 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1437  GntR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.05 
 
 		 470 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1569  GntR family transcriptional regulator  51.24 
 
 		 491 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  50.11 
 
 		 470 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  50.54 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 482 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 481 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 470 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.11 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 489 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  50.11 
 
 		 476 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 473 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  46.34 
 
 		 472 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 473 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 473 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  48.71 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  46.79 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  42.83 
 
 		 473 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  42.95 
 
 		 473 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 532 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 473 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  42.43 
 
 		 475 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  42.74 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.98 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.34 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  41.08 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  40.9 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.3 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  42 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  45.05 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.3 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  41.26 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  42.64 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 472 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.42 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.77 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 478 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  42.37 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 470 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.77 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  42.37 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  42.37 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  42.37 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  42.37 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>