115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4479 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4479  putative hydroxylase  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5004  putative hydroxylase  98.68 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3575  putative hydroxylase  96.46 
 
 		 227 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.574336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7102  putative hydroxylase  86.78 
 
 		 227 aa  411  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0219  putative hydroxylase  87.17 
 
 		 227 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5374  putative hydroxylase  74.56 
 
 		 227 aa  352  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983229  normal  0.422627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2877  putative hydroxylase  71.49 
 
 		 228 aa  338  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3078  putative hydroxylase  71.05 
 
 		 228 aa  334  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3916  putative hydroxylase  68.86 
 
 		 228 aa  328  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.721944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3803  putative hydroxylase  68.86 
 
 		 228 aa  328  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327184 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0990  2OG-Fe(II) oxygenase  62.83 
 
 		 225 aa  294  7e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3637  putative hydroxylase  61.3 
 
 		 228 aa  290  9e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2812  putative hydroxylase  60.53 
 
 		 226 aa  285  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.192542  decreased coverage  0.000000224129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3725  hypothetical protein  61.23 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.780792 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3557  putative hydroxylase  60.09 
 
 		 227 aa  277  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4810  putative hydroxylase  60.09 
 
 		 227 aa  277  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5473  putative hydroxylase  60.09 
 
 		 227 aa  277  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0632728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1077  putative hydroxylase  60.96 
 
 		 227 aa  275  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1201  putative hydroxylase  60.09 
 
 		 227 aa  275  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0892  putative hydroxylase  58.77 
 
 		 227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132513  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1690  putative hydroxylase  59.65 
 
 		 227 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1609  putative hydroxylase  59.65 
 
 		 227 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3793  putative hydroxylase  58.77 
 
 		 227 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4714  putative hydroxylase  59.21 
 
 		 227 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.730869 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4192  putative hydroxylase  59.21 
 
 		 227 aa  271  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0200  putative hydroxylase  59.21 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0103343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0838  putative hydroxylase  59.39 
 
 		 228 aa  269  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58580  putative hydroxylase  57.71 
 
 		 226 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00121484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2317  putative hydroxylase  56.77 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000110026  hitchhiker  0.000149055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12420  putative hydroxylase  57.71 
 
 		 226 aa  268  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.455137  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4677  putative hydroxylase  56.33 
 
 		 227 aa  266  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000773199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0236  2OG-Fe(II) oxygenase  58.59 
 
 		 226 aa  266  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.740629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0106  2OG-Fe(II) oxygenase  58.33 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3244  putative hydroxylase  54.42 
 
 		 224 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054374  hitchhiker  0.00000245191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0717  putative hydroxylase  54.42 
 
 		 224 aa  263  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266806  hitchhiker  0.000189122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0045  putative hydroxylase  58.33 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5129  putative hydroxylase  55.95 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482297  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4660  putative hydroxylase  56.14 
 
 		 227 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0792  putative hydroxylase  56.14 
 
 		 227 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182432  normal  0.929966 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7101  putative hydroxylase  54.39 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0698  putative hydroxylase  53.98 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00417487  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1130  putative hydroxylase  57.89 
 
 		 227 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3913  putative hydroxylase  52.65 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0577  2OG-Fe(II) oxygenase  55.31 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0176076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4316  putative hydroxylase  54.82 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0120702 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1709  putative hydroxylase  54.31 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.822877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0099  2OG-Fe(II) oxygenase  56.58 
 
 		 227 aa  254  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1638  putative hydroxylase  54.31 
 
 		 230 aa  254  6e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0862  putative hydroxylase  54.39 
 
 		 226 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0799  putative hydroxylase  54.39 
 
 		 226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0377  putative hydroxylase  53.07 
 
 		 226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0905  putative hydroxylase  54.39 
 
 		 226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0497199 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0828  putative hydroxylase  52.65 
 
 		 225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0741  putative hydroxylase  53.1 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0366446  hitchhiker  0.0000066194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00771  putative hydroxylase  52.65 
 
 		 225 aa  252  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2838  2OG-Fe(II) oxygenase  52.65 
 
 		 225 aa  252  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00788  hypothetical protein  52.65 
 
 		 225 aa  252  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3634  putative hydroxylase  53.1 
 
 		 224 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0859  putative hydroxylase  52.65 
 
 		 225 aa  252  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2839  putative hydroxylase  52.65 
 
 		 225 aa  252  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.113073 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0872  putative hydroxylase  52.65 
 
 		 225 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2548  putative hydroxylase  52.65 
 
 		 225 aa  251  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0721  putative hydroxylase  53.1 
 
 		 252 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000319663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0750  putative hydroxylase  53.1 
 
 		 252 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.904412  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1809  2OG-Fe(II) oxygenase  55.95 
 
 		 228 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0892  putative hydroxylase  53.95 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.137748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2089  putative hydroxylase  56.09 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1514  putative hydroxylase  56.09 
 
 		 229 aa  248  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3334  putative hydroxylase  54.78 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0690816  normal  0.437526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3541  putative hydroxylase  55.22 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0953  putative hydroxylase  51.97 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3968  putative hydroxylase  56.09 
 
 		 229 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0528  putative hydroxylase  55.07 
 
 		 227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1949  2OG-Fe(II) oxygenase  53.54 
 
 		 227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1313  putative hydroxylase  57.35 
 
 		 209 aa  241  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1570  2OG-Fe(II) oxygenase  51.5 
 
 		 231 aa  241  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0512  putative hydroxylase  55.07 
 
 		 234 aa  241  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.647783  normal  0.011367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4046  putative hydroxylase  54.39 
 
 		 227 aa  241  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12340  putative hydroxylase  53.95 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2273  putative hydroxylase  51.1 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1172  2OG-Fe(II) oxygenase  52.42 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3048  putative hydroxylase  48.91 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0701  putative hydroxylase  49.56 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0803  putative hydroxylase  50.44 
 
 		 222 aa  231  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3084  putative hydroxylase  50.22 
 
 		 227 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.418159  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2559  putative hydroxylase  48.91 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546533 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1523  2OG-Fe(II) oxygenase  40.54 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0612  2OG-Fe(II) oxygenase  43.86 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03560  putative hydroxylase  41.41 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0015  putative hydroxylase  43.81 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal  0.457656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1929  putative hydroxylase  40.71 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2258  putative hydroxylase  41.59 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0352243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2196  putative hydroxylase  41.15 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2199  2OG-Fe(II) oxygenase  39.38 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.568044  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20491  putative hydroxylase  39.91 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0096  putative hydroxylase  54.07 
 
 		 176 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1675  putative hydroxylase  42.04 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.899153  normal  0.0319364 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13531  putative hydroxylase  35.19 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12561  putative hydroxylase  34.68 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131814 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16191  putative hydroxylase  36.41 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>