208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4466 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 508 aa  1018    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  96.06 
 
 		 508 aa  984    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  60.59 
 
 		 510 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  33.59 
 
 		 519 aa  269  8e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  39.36 
 
 		 511 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  34.04 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  37.13 
 
 		 505 aa  229  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  37.17 
 
 		 490 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  33.84 
 
 		 596 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  37.11 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  32.48 
 
 		 504 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  32.86 
 
 		 487 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  34 
 
 		 543 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  33.94 
 
 		 513 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  36.67 
 
 		 512 aa  200  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  36.74 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  35.77 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  31.32 
 
 		 494 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  34.06 
 
 		 514 aa  177  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  33.59 
 
 		 540 aa  177  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  33.88 
 
 		 510 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  34.45 
 
 		 494 aa  157  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  34.25 
 
 		 508 aa  156  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  29.9 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  29.63 
 
 		 505 aa  143  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  28.22 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  28.66 
 
 		 505 aa  136  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  32.47 
 
 		 318 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  32.63 
 
 		 512 aa  131  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  31.39 
 
 		 520 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  31.01 
 
 		 498 aa  128  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  28.31 
 
 		 502 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  29.75 
 
 		 509 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  36.09 
 
 		 540 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  36.09 
 
 		 540 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  36.09 
 
 		 540 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  35.6 
 
 		 588 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  25.72 
 
 		 510 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  35.83 
 
 		 545 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  34.55 
 
 		 327 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  35.09 
 
 		 328 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  28.13 
 
 		 519 aa  113  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  35.99 
 
 		 511 aa  113  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  35.71 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  34.2 
 
 		 545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  33.66 
 
 		 543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  28.73 
 
 		 489 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  28.73 
 
 		 489 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  28.02 
 
 		 529 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  35.54 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  35.54 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  37.15 
 
 		 577 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  36.14 
 
 		 691 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  36.01 
 
 		 688 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  34.93 
 
 		 640 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  34.93 
 
 		 640 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  35.05 
 
 		 649 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  34.93 
 
 		 640 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  30.07 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  30.06 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  34.07 
 
 		 310 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  35.79 
 
 		 643 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  31.45 
 
 		 292 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  37.56 
 
 		 291 aa  97.1  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  29.94 
 
 		 520 aa  90.9  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  34.43 
 
 		 208 aa  90.1  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  32.7 
 
 		 315 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  29.95 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  26 
 
 		 521 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  30.74 
 
 		 508 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  25 
 
 		 435 aa  88.2  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  25 
 
 		 435 aa  88.2  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  31.02 
 
 		 313 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  25 
 
 		 435 aa  88.2  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  30.28 
 
 		 498 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  30.74 
 
 		 508 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  30.62 
 
 		 508 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  29.25 
 
 		 539 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  32.94 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  33.81 
 
 		 208 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  31.79 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  29.96 
 
 		 501 aa  83.2  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  32.02 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  30.23 
 
 		 719 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  27.27 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  27.03 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  30.39 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  28.21 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  31.78 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  30.95 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  26.78 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  26.78 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  28.23 
 
 		 495 aa  80.1  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  26.54 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  29.35 
 
 		 721 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  31.69 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  29.46 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  27.5 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  27.86 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  27.86 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>