167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4364 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  97.63 
 
 		 2366 aa  3749    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  44.59 
 
 		 3506 aa  729    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  82.77 
 
 		 2396 aa  3241    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  48.38 
 
 		 4238 aa  1015    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  63.82 
 
 		 1508 aa  1223    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  48.72 
 
 		 3822 aa  1034    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  51.01 
 
 		 3629 aa  843    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  47.97 
 
 		 3954 aa  1061    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 2371 aa  4239    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  86.62 
 
 		 2346 aa  3315    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  48.68 
 
 		 4238 aa  1035    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  86.64 
 
 		 2365 aa  3354    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1881 aa  508  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  36.27 
 
 		 1119 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.02 
 
 		 1848 aa  439  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  43.06 
 
 		 2711 aa  429  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.38 
 
 		 1227 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  34.21 
 
 		 1782 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  39.97 
 
 		 1971 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  41.07 
 
 		 986 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  41.38 
 
 		 995 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  36.06 
 
 		 2003 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.11 
 
 		 1285 aa  383  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.15 
 
 		 1029 aa  370  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  34.26 
 
 		 1519 aa  344  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  36.54 
 
 		 650 aa  343  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  34.93 
 
 		 2906 aa  340  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  38.58 
 
 		 1033 aa  336  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  37.24 
 
 		 1004 aa  327  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  37.46 
 
 		 991 aa  305  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  34.83 
 
 		 990 aa  300  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  36.97 
 
 		 995 aa  296  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  36.2 
 
 		 1055 aa  295  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  36.84 
 
 		 983 aa  294  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  32.47 
 
 		 1530 aa  294  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  36.73 
 
 		 1028 aa  293  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  35.82 
 
 		 1038 aa  286  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6534  outer membrane autotransporter barrel  52.01 
 
 		 415 aa  286  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0435676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.2 
 
 		 919 aa  286  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  40.42 
 
 		 1053 aa  285  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  37.2 
 
 		 1001 aa  282  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  40.68 
 
 		 1459 aa  280  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  51.01 
 
 		 1550 aa  273  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  35.84 
 
 		 1001 aa  271  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  38.64 
 
 		 1172 aa  268  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.67 
 
 		 972 aa  262  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  34.83 
 
 		 1164 aa  261  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35 
 
 		 1011 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  29.63 
 
 		 1056 aa  255  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  35.95 
 
 		 985 aa  253  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  34.69 
 
 		 1333 aa  253  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  31.88 
 
 		 3322 aa  248  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  35.6 
 
 		 994 aa  237  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  34.2 
 
 		 1129 aa  236  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  34.2 
 
 		 1131 aa  235  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  34.06 
 
 		 1129 aa  233  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  34.06 
 
 		 1131 aa  233  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  34.06 
 
 		 1131 aa  233  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  34.06 
 
 		 1131 aa  233  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  37.23 
 
 		 1130 aa  226  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  36.13 
 
 		 1131 aa  224  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  35.97 
 
 		 980 aa  223  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  36.28 
 
 		 2578 aa  219  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  35.17 
 
 		 1062 aa  209  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  33.83 
 
 		 1016 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  30.46 
 
 		 677 aa  203  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  33.69 
 
 		 1152 aa  203  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  30.97 
 
 		 1111 aa  200  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  31.74 
 
 		 1006 aa  199  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.64 
 
 		 1081 aa  199  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  33 
 
 		 3420 aa  197  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  32.93 
 
 		 3415 aa  197  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.53 
 
 		 1322 aa  193  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.68 
 
 		 1532 aa  188  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  32.08 
 
 		 1011 aa  171  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.21 
 
 		 1125 aa  162  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.46 
 
 		 1694 aa  160  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  42.09 
 
 		 1458 aa  157  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  38.86 
 
 		 3391 aa  149  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  34.29 
 
 		 1882 aa  149  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  37.65 
 
 		 1113 aa  144  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  42.56 
 
 		 1593 aa  143  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  30.83 
 
 		 882 aa  140  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  30.77 
 
 		 1180 aa  140  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  33.44 
 
 		 1130 aa  139  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  33.09 
 
 		 488 aa  136  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  32.17 
 
 		 816 aa  135  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  32.63 
 
 		 407 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  44.89 
 
 		 2363 aa  133  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.53 
 
 		 1741 aa  132  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  37.98 
 
 		 2926 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  28.93 
 
 		 2057 aa  123  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  38.84 
 
 		 861 aa  120  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  33.29 
 
 		 2642 aa  117  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  40.78 
 
 		 950 aa  116  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  37.83 
 
 		 2407 aa  113  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.22 
 
 		 3089 aa  112  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  29.85 
 
 		 1019 aa  112  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.44 
 
 		 1769 aa  110  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  28.52 
 
 		 814 aa  108  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>