21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4359 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4359  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
122 aa  251  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  1.89574e-08  unclonable  4.50981e-06 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4876  antibiotic biosynthesis monooxygenase  99.18 
 
 
122 aa  248  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  2.10055e-05  hitchhiker  1.62299e-09 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0764  antibiotic biosynthesis monooxygenase  90.98 
 
 
122 aa  226  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00475722  hitchhiker  6.87435e-05 
 
 
 
NC_010515  Bcenmc03_5360  antibiotic biosynthesis monooxygenase  90.98 
 
 
122 aa  226  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000102648  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4927  antibiotic biosynthesis monooxygenase  88.52 
 
 
122 aa  222  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.11834e-08  normal  0.0525996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3440  antibiotic biosynthesis monooxygenase  88.52 
 
 
122 aa  222  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  8.426e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1850  hypothetical protein  75.68 
 
 
164 aa  177  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0857051 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3056  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.11 
 
 
145 aa  169  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.708736  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1169  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.02 
 
 
125 aa  154  5e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2213  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.1 
 
 
123 aa  136  8e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.739049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5372  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.72 
 
 
123 aa  109  1e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274655  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3150  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.65 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2800  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.96 
 
 
269 aa  48.1  4e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000207349  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0769988  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16440  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 
209 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 
100 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5024  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1704  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.653173  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1686  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  34.29 
 
 
274 aa  40.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>