19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4352 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4352  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000403824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4868  hypothetical protein  98.85 
 
 		 87 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.149916  hitchhiker  0.000016911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5369  hypothetical protein  89.77 
 
 		 88 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0526662  normal  0.150466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3449  hypothetical protein  89.77 
 
 		 88 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4917  hypothetical protein  89.77 
 
 		 88 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000538431  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3695  hypothetical protein  87.5 
 
 		 88 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423851  normal  0.445394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0774  hypothetical protein  85.23 
 
 		 88 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38776  normal  0.0145475 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0052  hypothetical protein  70.73 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00361397  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1568  hypothetical protein  70.73 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00871476  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0869  hypothetical protein  70.73 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0961  hypothetical protein  70.73 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0495124  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2210  hypothetical protein  70.73 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00304758  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1763  hypothetical protein  70.73 
 
 		 89 aa  120  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00872909  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1148  hypothetical protein  66.15 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5272  hypothetical protein  62.12 
 
 		 93 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.710827  normal  0.0618607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5459  hypothetical protein  63.08 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3305  hypothetical protein  47.83 
 
 		 69 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.892491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0654  hypothetical protein  52.54 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1197  hypothetical protein  40.74 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.878093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>