More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4328 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4328  porin  100 
 
 		 391 aa  793    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  60.98 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  58.13 
 
 		 382 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  59.84 
 
 		 389 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  59.84 
 
 		 389 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  59.57 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  54.36 
 
 		 386 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  57.77 
 
 		 382 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  57.77 
 
 		 382 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  54.79 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  46.51 
 
 		 381 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  47.91 
 
 		 386 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  48.63 
 
 		 384 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  46.3 
 
 		 383 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  48.36 
 
 		 384 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  44.3 
 
 		 383 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  46.51 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  47.81 
 
 		 384 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  45.62 
 
 		 381 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  48.17 
 
 		 382 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  47.41 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  47.41 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  47.41 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  47.41 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  47.41 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  47.41 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  47.41 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  47.96 
 
 		 414 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  48.11 
 
 		 383 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  46.99 
 
 		 384 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  46.99 
 
 		 384 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  46.99 
 
 		 384 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  45.99 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  45.92 
 
 		 396 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  46.77 
 
 		 384 aa  315  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  45.22 
 
 		 394 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  46.15 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  44.19 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  46.47 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  43.65 
 
 		 381 aa  295  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  44.56 
 
 		 381 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  43.65 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  44.8 
 
 		 374 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  43.4 
 
 		 383 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  43.85 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  45.48 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  43.08 
 
 		 379 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  43.33 
 
 		 379 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  43.08 
 
 		 379 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  43.08 
 
 		 379 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  46.21 
 
 		 375 aa  289  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  43.08 
 
 		 379 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  44.8 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  44.84 
 
 		 380 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  44.53 
 
 		 377 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  44.57 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  43.7 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  44.53 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  41.43 
 
 		 383 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  44.28 
 
 		 403 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  41.69 
 
 		 383 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  44 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  44 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  43.6 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  42.93 
 
 		 384 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  44.36 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  42.55 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  43.25 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  41.09 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  40.2 
 
 		 389 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  40.25 
 
 		 390 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  41.15 
 
 		 384 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  42.39 
 
 		 380 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  41.5 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  41 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  41 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  41 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  40.65 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  40.65 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  40.65 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  40.65 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  39.75 
 
 		 379 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  40.65 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  42.06 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  41.37 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  40.5 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  39.3 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  42.29 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  41.42 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  40.5 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  41.04 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  41.42 
 
 		 380 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  42.18 
 
 		 409 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  38.73 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4838  porin  38.58 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  40.55 
 
 		 418 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  40.66 
 
 		 386 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1125  outer membrane porin OpcP, putative  40.89 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0227  putative outer membrane porin  40.89 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  40.77 
 
 		 366 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>