More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4200 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  62.93 
 
 		 501 aa  651    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1197  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  75.69 
 
 		 506 aa  707    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2070  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  74.14 
 
 		 859 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0501003  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  94.07 
 
 		 506 aa  962    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2434  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  74.76 
 
 		 540 aa  731    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936114  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  98.81 
 
 		 506 aa  1008    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  94.47 
 
 		 506 aa  934    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  100 
 
 		 528 aa  1063    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  94.27 
 
 		 506 aa  964    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  94.47 
 
 		 506 aa  934    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  94.47 
 
 		 506 aa  934    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1641  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  74.14 
 
 		 534 aa  712    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0578251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0303  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  74.14 
 
 		 535 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0120484  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1908  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  73.95 
 
 		 535 aa  708    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00738158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1921  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  73.95 
 
 		 535 aa  711    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0857  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  74.14 
 
 		 535 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  67.55 
 
 		 497 aa  665    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  78.97 
 
 		 506 aa  823    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  78.28 
 
 		 511 aa  816    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2159  ABC transporter related  64.78 
 
 		 500 aa  628  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.634503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  60.48 
 
 		 496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  60.61 
 
 		 496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  60.48 
 
 		 496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  47.19 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  47.19 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  46.1 
 
 		 524 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  48.9 
 
 		 504 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  47.7 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.99 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.22 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  43.63 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  46.56 
 
 		 515 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  47.28 
 
 		 505 aa  428  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  46.29 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 		 508 aa  428  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.33 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  46.04 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  47.31 
 
 		 514 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 501 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  46.17 
 
 		 517 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.25 
 
 		 492 aa  427  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  47.31 
 
 		 514 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  46.06 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  46.77 
 
 		 501 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 510 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 		 523 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.84 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.65 
 
 		 512 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  47.31 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.7 
 
 		 514 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 492 aa  421  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  46.04 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.23 
 
 		 499 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  42.11 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  46.04 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.46 
 
 		 514 aa  418  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  42.89 
 
 		 505 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.97 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  42.6 
 
 		 496 aa  415  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  42.74 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  44.06 
 
 		 503 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  45.27 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  46.29 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.08 
 
 		 495 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  42.77 
 
 		 506 aa  415  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 498 aa  415  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  44.04 
 
 		 500 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.12 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  45.82 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  42.74 
 
 		 520 aa  411  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  46.65 
 
 		 511 aa  411  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  46.67 
 
 		 503 aa  412  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  44.27 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  45.86 
 
 		 498 aa  406  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  45.2 
 
 		 519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  44.02 
 
 		 499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  43.09 
 
 		 492 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  45.72 
 
 		 508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  42.49 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0962  ABC transporter related  44.24 
 
 		 495 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  43.46 
 
 		 495 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.85 
 
 		 524 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.82 
 
 		 524 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.77 
 
 		 524 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  44.85 
 
 		 507 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  42.71 
 
 		 500 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  42.8 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>