31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4154 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4154  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4678  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  93.79 
 
 
306 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.424256  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3596  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  82.35 
 
 
306 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4771  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  83.45 
 
 
297 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0943  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  84.54 
 
 
291 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5512  phosphatidylinositol-specific phospholipase C X region  83.85 
 
 
291 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.053033  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5471  Phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  39.43 
 
 
325 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.427278  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0086  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  34 
 
 
328 aa  122  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0083  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  34 
 
 
328 aa  122  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1713  1-phosphatidylinositol phosphodiesterase (Phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase) (Phosphatidylinositol-specific phospholipase C) (PI-PLC)  29.24 
 
 
471 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000119858 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1438  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  30.21 
 
 
326 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00194348  hitchhiker  0.00010452 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3771  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  27.8 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000319022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3860  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  27.8 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.133194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3532  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  27.89 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3891  1-phosphatidylinositol phosphodiesterase  27.99 
 
 
329 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3501  glycosylphosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  27.8 
 
 
329 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000999913  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3604  1-phosphatidylinositol phosphodiesterase  27.99 
 
 
329 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00660828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3513  glycosylphosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  33.33 
 
 
329 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3801  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  33.33 
 
 
329 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000171037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3793  1-phosphatidylinositol phosphodiesterase  27.8 
 
 
329 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00985901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3757  Phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  30.99 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325914  normal  0.37365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2347  phosphatidylinositol-specific phospholipase C X region  29.95 
 
 
471 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.152355  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70308  predicted protein  27.1 
 
 
297 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.80881  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03636  phosphatidylinositol phospholipase C (AFU_orthologue; AFUA_4G12000)  28.53 
 
 
485 aa  106  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05780  expressed protein  31.4 
 
 
430 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.490409  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6736  phosphatidylinositol-specific phospholipase C X region  29.86 
 
 
320 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48445  predicted protein  32.37 
 
 
489 aa  55.8  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1585  hypothetical protein  25 
 
 
282 aa  54.3  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2839  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  26.9 
 
 
822 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2642  hypothetical protein  30.91 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0819  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  24.86 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>