More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4147 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  100 
 
 
423 aa  839    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  72.58 
 
 
428 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  72.68 
 
 
445 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  74.33 
 
 
429 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  72.34 
 
 
445 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  73.33 
 
 
432 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  73.03 
 
 
398 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  73.03 
 
 
398 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  73.03 
 
 
398 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  65.04 
 
 
415 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  65.04 
 
 
415 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  65.21 
 
 
416 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  63.1 
 
 
434 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  60.28 
 
 
474 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  63.14 
 
 
430 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  60.05 
 
 
474 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  59.81 
 
 
474 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  59.57 
 
 
457 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  59.57 
 
 
457 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  59.57 
 
 
474 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  59.57 
 
 
474 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  60.53 
 
 
429 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  61.33 
 
 
435 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  59.86 
 
 
424 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  59.62 
 
 
424 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  59.86 
 
 
428 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  59.86 
 
 
424 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  61.35 
 
 
421 aa  481  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  54.57 
 
 
435 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  51.08 
 
 
429 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  52.45 
 
 
409 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  52.21 
 
 
409 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  52.49 
 
 
411 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  54.55 
 
 
434 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  53.66 
 
 
432 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  49.76 
 
 
429 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  53.9 
 
 
432 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  54.07 
 
 
432 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  54.79 
 
 
434 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  53.66 
 
 
432 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  52.55 
 
 
428 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  52.81 
 
 
433 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  52.09 
 
 
428 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  53.09 
 
 
428 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  53.07 
 
 
427 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  51.85 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  51.85 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  52.33 
 
 
423 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  49.04 
 
 
423 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  52.33 
 
 
423 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  51.92 
 
 
420 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  51.92 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  51.92 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  51.92 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 
428 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  50.61 
 
 
430 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  50.72 
 
 
420 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  48.78 
 
 
409 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  49.52 
 
 
419 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  49.28 
 
 
419 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  58.02 
 
 
411 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  49.51 
 
 
436 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  47.93 
 
 
434 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  50 
 
 
437 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  49.64 
 
 
429 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  48.4 
 
 
425 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  48.4 
 
 
425 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  48.57 
 
 
436 aa  341  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  45.81 
 
 
423 aa  335  7e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  42.79 
 
 
441 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  43.95 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  38.95 
 
 
428 aa  299  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  40.57 
 
 
436 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  40.43 
 
 
428 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  35.21 
 
 
418 aa  207  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
451 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  31.2 
 
 
399 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  30.85 
 
 
399 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  30.85 
 
 
399 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  30.85 
 
 
399 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  30.85 
 
 
399 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  30.85 
 
 
399 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  30.86 
 
 
399 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  30.41 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  30.85 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  33.59 
 
 
415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  31.77 
 
 
412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  30.6 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  32.06 
 
 
491 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  29.18 
 
 
432 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  29.41 
 
 
432 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  29.41 
 
 
433 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  29.41 
 
 
433 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  32.4 
 
 
415 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.18 
 
 
432 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  31.68 
 
 
412 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.18 
 
 
432 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.18 
 
 
433 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.18 
 
 
433 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  29.25 
 
 
432 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>