152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4141 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  100 
 
 		 314 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  98.09 
 
 		 314 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0969  metallophosphoesterase  93.31 
 
 		 314 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3608  metallophosphoesterase  92.36 
 
 		 314 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4759  metallophosphoesterase  92.36 
 
 		 314 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5524  metallophosphoesterase  92.36 
 
 		 314 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.809123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  85.05 
 
 		 312 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1271  hypothetical protein  76.04 
 
 		 314 aa  494  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5326  metallophosphoesterase  75.4 
 
 		 314 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2979  hypothetical protein  52.13 
 
 		 314 aa  329  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4689  metallophosphoesterase  50.5 
 
 		 319 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596745  normal  0.125787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  51.63 
 
 		 313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2672  metallophosphoesterase  51.64 
 
 		 313 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0337269  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  53.04 
 
 		 335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  51.72 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  49.06 
 
 		 320 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  53.42 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2524  metallophosphoesterase  44.3 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  0.43864 
 
 
-
 
NC_003296  RS02211  hypothetical protein  38.43 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1407  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.62 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0774357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2421  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  36.62 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1898  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.62 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2256  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.62 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0412874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2295  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.62 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2176  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.97 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3409  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.63 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520768  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1171  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.63 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4252  twin-arginine translocation pathway signal  37.66 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  33.61 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1617  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.41 
 
 		 229 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  29 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  29.6 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  29.36 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  29.73 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  30.88 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  28.89 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  25.29 
 
 		 611 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  29.13 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  28.51 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  27.03 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  28.86 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.31 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  25.62 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  26.97 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.52 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.52 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.33 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  29.33 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.33 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.33 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  29.05 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.33 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  27.67 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  26.64 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  27.43 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  28.8 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  27.67 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0869  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  25.59 
 
 		 819 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  28.5 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0726  metallophosphoesterase  25.47 
 
 		 820 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.972215  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  27.52 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  24.02 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  26.84 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1325  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4466  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  25 
 
 		 820 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0777  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  24.89 
 
 		 824 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0815  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  24.89 
 
 		 819 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  27.97 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  32.67 
 
 		 774 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0726  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  25.35 
 
 		 824 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0712  phosphohydrolase  25.12 
 
 		 824 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  28.65 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  28.64 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0911  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  25.12 
 
 		 819 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.30065e-39 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  27.4 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  27.93 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  29.38 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  27.64 
 
 		 616 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  25.68 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0906  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  24.53 
 
 		 819 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  29.38 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  29.63 
 
 		 274 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  29.38 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0980  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  24.53 
 
 		 819 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  28 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  28.81 
 
 		 680 aa  55.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  26.48 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  26.29 
 
 		 606 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  30 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  28.57 
 
 		 1138 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  27.66 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  27.66 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  23.91 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  26.15 
 
 		 369 aa  52.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  25.22 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  27.24 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  24.04 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5275  hypothetical protein  25.44 
 
 		 496 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0193632  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  25.32 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>