17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4119 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4119  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000721644  hitchhiker  0.00853024 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4584  hypothetical protein  96.31 
 
 
253 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000199252  hitchhiker  0.0000764364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1049  hypothetical protein  87.76 
 
 
254 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.000000000000146795  normal  0.176851 
 
 
 
NC_008061  Bcen_3640  hypothetical protein  88.98 
 
 
245 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000426312  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4727  hypothetical protein  88.98 
 
 
245 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200998  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5573  hypothetical protein  88.03 
 
 
245 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175505  hitchhiker  0.00177599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3968  hypothetical protein  77.69 
 
 
241 aa  377  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395097  normal  0.0223462 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2482  hypothetical protein  58.37 
 
 
273 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1219  hypothetical protein  58.37 
 
 
282 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1291  hypothetical protein  58.37 
 
 
282 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132365  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0611  hypothetical protein  58.37 
 
 
282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0333  hypothetical protein  58.37 
 
 
282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0958  hypothetical protein  58.37 
 
 
282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1348  hypothetical protein  58.37 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1513  hypothetical protein  57.31 
 
 
270 aa  262  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175272  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0814  3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase  27.27 
 
 
399 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00207544 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0412  3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase  21.95 
 
 
410 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>