More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4047 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  95.5 
 
 		 444 aa  831    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  81.98 
 
 		 442 aa  709    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  81.98 
 
 		 442 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  81.98 
 
 		 442 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  81.98 
 
 		 442 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  81.76 
 
 		 442 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  91.67 
 
 		 444 aa  794    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  81.05 
 
 		 436 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  81.98 
 
 		 442 aa  709    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  98.2 
 
 		 444 aa  876    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  95.05 
 
 		 444 aa  829    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  81.98 
 
 		 442 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 455 aa  913    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  75.22 
 
 		 446 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  95.05 
 
 		 444 aa  829    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  72.1 
 
 		 446 aa  631  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  72.77 
 
 		 446 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  35 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  37.32 
 
 		 447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 445 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  37.38 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  38.26 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  35.5 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  33.18 
 
 		 460 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 442 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 441 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 430 aa  226  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 431 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 441 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 441 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 441 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 441 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 		 446 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 441 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 441 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 441 aa  205  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  32.81 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 441 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 441 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 441 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 		 466 aa  189  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 441 aa  189  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  32.95 
 
 		 441 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 442 aa  176  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 471 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 385 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.25 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 388 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 390 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  27.75 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 383 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 385 aa  127  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 377 aa  124  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 381 aa  120  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  28.88 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 378 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 492 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 984 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  25.24 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>