More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3986 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  99.11 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  95.98 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  60.1 
 
 		 227 aa  246  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  42.38 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  34.12 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  32.7 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  34.31 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 194 aa  88.2  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  33.77 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  33.12 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  34.64 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 240 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  33.54 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  31.01 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.05 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  35.77 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  32.1 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  33.81 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  34.4 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0223  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4903  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22960  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.483405  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3759  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5832  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2967  GntR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  31.01 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  29.45 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>