More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3934 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  88.56 
 
 		 1405 aa  2486    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  58.63 
 
 		 1357 aa  1583    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  58.41 
 
 		 1338 aa  1576    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  76.32 
 
 		 1418 aa  2145    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  58.4 
 
 		 1405 aa  1569    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  55.15 
 
 		 1342 aa  1434    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  76.11 
 
 		 1418 aa  2139    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  76.25 
 
 		 1418 aa  2142    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  76.92 
 
 		 1398 aa  2151    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  93.63 
 
 		 1395 aa  2660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  75.7 
 
 		 1427 aa  2134    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  58.34 
 
 		 1341 aa  1575    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  76.39 
 
 		 1418 aa  2145    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  71.09 
 
 		 1403 aa  2015    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  60.03 
 
 		 1383 aa  1669    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  56.13 
 
 		 1394 aa  1419    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  71.38 
 
 		 1401 aa  2041    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  98.5 
 
 		 1397 aa  2810    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  93.27 
 
 		 1395 aa  2592    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  59.8 
 
 		 1396 aa  1571    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  61.46 
 
 		 1407 aa  1724    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  93.41 
 
 		 1395 aa  2596    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  63.77 
 
 		 1271 aa  942    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  61.58 
 
 		 1232 aa  894    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  51.41 
 
 		 1313 aa  1372    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  72.36 
 
 		 1400 aa  2039    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  76.25 
 
 		 1418 aa  2142    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  53.75 
 
 		 1370 aa  1357    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  61.58 
 
 		 1409 aa  1736    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 1397 aa  2849    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  63.77 
 
 		 1271 aa  944    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  93.41 
 
 		 1395 aa  2596    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  54.47 
 
 		 1317 aa  1449    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  76.25 
 
 		 1418 aa  2142    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  56.69 
 
 		 1384 aa  1558    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  63.77 
 
 		 1271 aa  942    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  68.48 
 
 		 1257 aa  1013    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  53.75 
 
 		 1312 aa  1444    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  43.54 
 
 		 716 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  41.4 
 
 		 746 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  45.48 
 
 		 894 aa  572  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  40.99 
 
 		 746 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  43.21 
 
 		 901 aa  569  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  41.39 
 
 		 1176 aa  568  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.58 
 
 		 905 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  42.09 
 
 		 908 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  42.11 
 
 		 729 aa  559  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.44 
 
 		 951 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  41.68 
 
 		 906 aa  556  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.52 
 
 		 907 aa  554  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  42.06 
 
 		 1180 aa  556  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  43.13 
 
 		 906 aa  555  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  43.9 
 
 		 951 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  40.16 
 
 		 727 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  40.3 
 
 		 946 aa  551  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  41.4 
 
 		 724 aa  553  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.5 
 
 		 951 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.63 
 
 		 951 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.52 
 
 		 904 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  43.63 
 
 		 951 aa  549  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.5 
 
 		 951 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.36 
 
 		 951 aa  546  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  41.9 
 
 		 908 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.36 
 
 		 951 aa  546  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  38.66 
 
 		 757 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  39.67 
 
 		 958 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  41.26 
 
 		 931 aa  543  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  40.68 
 
 		 743 aa  538  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  40.25 
 
 		 743 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  40.81 
 
 		 1228 aa  536  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.18 
 
 		 929 aa  535  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  40.27 
 
 		 734 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  40.68 
 
 		 879 aa  529  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  44.21 
 
 		 1173 aa  528  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  41.18 
 
 		 952 aa  528  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.18 
 
 		 952 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  40.29 
 
 		 953 aa  526  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  40.7 
 
 		 885 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  41.95 
 
 		 933 aa  523  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  39.62 
 
 		 955 aa  523  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.49 
 
 		 986 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  38.81 
 
 		 1171 aa  515  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  39.15 
 
 		 758 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  40.96 
 
 		 885 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  41.26 
 
 		 954 aa  513  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1450  molybdopterin oxidoreductase  41.48 
 
 		 885 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16865  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  44.72 
 
 		 628 aa  511  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  37.72 
 
 		 905 aa  506  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  39.46 
 
 		 897 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  41.88 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.89 
 
 		 1003 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  37.86 
 
 		 896 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  41.39 
 
 		 885 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  40.86 
 
 		 915 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  39.72 
 
 		 1188 aa  509  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  40.86 
 
 		 915 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.64 
 
 		 906 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  41.51 
 
 		 752 aa  499  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  41.37 
 
 		 752 aa  499  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  41.61 
 
 		 933 aa  496  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>