More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3863 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.03 
 
 		 581 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  74.45 
 
 		 636 aa  832    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  74.45 
 
 		 636 aa  832    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  74.61 
 
 		 636 aa  832    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  91.78 
 
 		 619 aa  1055    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  90.13 
 
 		 595 aa  1009    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  68.76 
 
 		 598 aa  740    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  98.65 
 
 		 594 aa  1158    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.47 
 
 		 595 aa  740    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  73.31 
 
 		 602 aa  780    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  74.22 
 
 		 636 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  91.62 
 
 		 597 aa  1061    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  91.79 
 
 		 597 aa  1063    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 594 aa  1169    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.1 
 
 		 592 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  91.62 
 
 		 597 aa  1061    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  74.61 
 
 		 636 aa  834    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  74.45 
 
 		 636 aa  832    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  74.45 
 
 		 636 aa  832    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  70.52 
 
 		 257 aa  358  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  65.68 
 
 		 274 aa  350  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  65.07 
 
 		 274 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.53 
 
 		 260 aa  349  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  66.27 
 
 		 268 aa  346  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.76 
 
 		 567 aa  346  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.27 
 
 		 261 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  68.92 
 
 		 272 aa  345  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  65.38 
 
 		 261 aa  343  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3710  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.66 
 
 		 365 aa  342  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.3 
 
 		 567 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.87 
 
 		 254 aa  340  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1640  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.37 
 
 		 559 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  64.29 
 
 		 274 aa  337  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  69.72 
 
 		 272 aa  334  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  65.37 
 
 		 275 aa  333  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 		 506 aa  332  9e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  70.92 
 
 		 299 aa  332  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.14 
 
 		 352 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  65.86 
 
 		 264 aa  328  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  65.91 
 
 		 279 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.31 
 
 		 502 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  64.4 
 
 		 256 aa  322  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3010  amino acid ABC transporter, permease protein  58.5 
 
 		 324 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 		 500 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2891  amino acid ABC transporter permease  57.48 
 
 		 329 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0444543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  62.14 
 
 		 254 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.53 
 
 		 500 aa  316  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  0.451936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.17 
 
 		 510 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2493  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.43 
 
 		 321 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.761047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  61.45 
 
 		 253 aa  312  9e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.86 
 
 		 543 aa  312  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.406316  normal  0.927008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02270  amino acid ABC transporter membrane protein  53.79 
 
 		 369 aa  311  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.09 
 
 		 314 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  59.84 
 
 		 263 aa  310  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  58.52 
 
 		 267 aa  309  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.83 
 
 		 512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  61.48 
 
 		 260 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  60.64 
 
 		 273 aa  306  7e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1185  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.71 
 
 		 295 aa  306  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.19 
 
 		 510 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  61.63 
 
 		 255 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  61.07 
 
 		 260 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  59.84 
 
 		 254 aa  304  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  60.66 
 
 		 250 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  60.64 
 
 		 264 aa  303  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  60.25 
 
 		 250 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.33 
 
 		 502 aa  302  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  61.22 
 
 		 267 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  60.25 
 
 		 254 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  58.63 
 
 		 259 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4083  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.1 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 		 254 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 		 510 aa  296  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  59.84 
 
 		 256 aa  296  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2087  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.66 
 
 		 306 aa  296  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  37.8 
 
 		 507 aa  296  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  60.82 
 
 		 252 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.82 
 
 		 516 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0522  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.7 
 
 		 306 aa  293  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  57.26 
 
 		 264 aa  292  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  55.74 
 
 		 254 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  56.63 
 
 		 256 aa  291  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  59.84 
 
 		 262 aa  291  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  57.43 
 
 		 259 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 		 254 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.82 
 
 		 263 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  58.06 
 
 		 258 aa  289  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6505  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.64 
 
 		 536 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  56.97 
 
 		 261 aa  285  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.56 
 
 		 254 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  55.42 
 
 		 256 aa  283  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  57.03 
 
 		 256 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  58.5 
 
 		 256 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54.58 
 
 		 263 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1137  ABC transporter related  56.91 
 
 		 254 aa  281  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.43 
 
 		 250 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  57.32 
 
 		 255 aa  280  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  55.51 
 
 		 254 aa  279  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.22 
 
 		 276 aa  279  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34670  amino acid ABC transporter membrane protein  53.54 
 
 		 374 aa  278  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>