202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3834 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  100 
 
 
536 aa  1000    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  63.89 
 
 
575 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  57.09 
 
 
589 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  58.16 
 
 
655 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  44.96 
 
 
597 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  45.32 
 
 
597 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  45.32 
 
 
597 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  44.98 
 
 
1417 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  38.45 
 
 
1072 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  39.37 
 
 
898 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  37.13 
 
 
1654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  43.65 
 
 
967 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  36.53 
 
 
877 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  37.36 
 
 
4384 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  34.53 
 
 
1669 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  39.39 
 
 
1090 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  38.83 
 
 
1074 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  39.39 
 
 
1122 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  37.27 
 
 
1440 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  39.39 
 
 
1090 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  35.03 
 
 
715 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  39.39 
 
 
1090 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  39.39 
 
 
1122 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  39.39 
 
 
1122 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  34.53 
 
 
1535 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  37.02 
 
 
1190 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  39.37 
 
 
831 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  39.37 
 
 
831 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  38.83 
 
 
831 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  39.37 
 
 
820 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  34.53 
 
 
1626 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  39.37 
 
 
816 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  39.37 
 
 
816 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  39.37 
 
 
816 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  39.37 
 
 
816 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  35.7 
 
 
737 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  36.56 
 
 
472 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  38.2 
 
 
1012 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  37.67 
 
 
1117 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  37.92 
 
 
1068 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  34.28 
 
 
810 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  35.32 
 
 
827 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  32.98 
 
 
1916 aa  144  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  38.11 
 
 
2025 aa  144  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  37.14 
 
 
2814 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  46.29 
 
 
2504 aa  143  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  36.65 
 
 
1197 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  37.99 
 
 
330 aa  143  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  36.65 
 
 
1197 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  36.65 
 
 
1197 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  35.44 
 
 
962 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  36.71 
 
 
1451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  45.71 
 
 
1390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  34.49 
 
 
548 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  37.46 
 
 
1204 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  34.21 
 
 
2866 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  36.85 
 
 
2728 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  36.85 
 
 
2778 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  39.7 
 
 
1326 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  36.14 
 
 
1125 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  37.43 
 
 
3635 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  35.86 
 
 
617 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  39.22 
 
 
2868 aa  134  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  35.01 
 
 
650 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  39.18 
 
 
977 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  36.44 
 
 
2757 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  36.44 
 
 
1916 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  32.2 
 
 
1616 aa  126  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  36.88 
 
 
2396 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  31.77 
 
 
572 aa  125  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  34.75 
 
 
876 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  35.19 
 
 
880 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  30.33 
 
 
1549 aa  124  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  31.76 
 
 
716 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  30.48 
 
 
1342 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  30.48 
 
 
1447 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  30.48 
 
 
1447 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  36.14 
 
 
2141 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  31.06 
 
 
595 aa  121  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  35.25 
 
 
735 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  29.61 
 
 
1446 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  29.48 
 
 
1616 aa  120  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  29.48 
 
 
1616 aa  120  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  45.81 
 
 
423 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  38.8 
 
 
4726 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  34.11 
 
 
1230 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  39.74 
 
 
1186 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  29.61 
 
 
1472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  29.07 
 
 
1674 aa  118  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  31.58 
 
 
716 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  29.11 
 
 
1588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  44.94 
 
 
3126 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  39.02 
 
 
3192 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  33.19 
 
 
2505 aa  114  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  46.99 
 
 
2493 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2042  putative cell surface protein  35.35 
 
 
365 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  34.84 
 
 
601 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  37.73 
 
 
1713 aa  111  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  33.58 
 
 
492 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  35.62 
 
 
2832 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>